24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2869 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2869  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  225  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5342  XRE family transcriptional regulator  55.75 
 
 		 113 aa  121  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.987751 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  44.66 
 
 		 114 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0225  hypothetical protein  43.81 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9055  hypothetical protein  43.53 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142837  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0476  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2503  hypothetical protein  40.2 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5343  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.992998 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6229  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2078  XRE family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6889  XRE family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934247 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6143  hypothetical protein  35.96 
 
 		 122 aa  52  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927936  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0236  helix-turn-helix domain protein  42.35 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4199  hypothetical protein  34.18 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.335436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4943  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0625  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000512612 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1565  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0227  transcriptional regulator, XRE family  32.29 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1558  transcriptional regulator, XRE family  32.04 
 
 		 114 aa  43.5  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3278  transcriptional regulator, XRE family  32.47 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0655244  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0860  transcriptional regulator, putative  32.53 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000051396 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7390  putative DNA binding protein  36.23 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>