26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0212 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0212  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 68 aa  135  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0249  XRE family transcriptional regulator  97.06 
 
 		 68 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2168  transcriptional regulator, XRE family  85.29 
 
 		 68 aa  120  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117298  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0857  transcriptional regulator, putative  56.92 
 
 		 74 aa  78.2  0.00000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000197317 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0496  DNA-binding protein, putative  55.38 
 
 		 72 aa  77  0.00000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0510  XRE family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5678  XRE family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.669501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6295  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1196  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.151247 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2260  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2426  hypothetical protein  37.5 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2711  hypothetical protein  43.14 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0830  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.0000289664  hitchhiker  0.0000066158 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1776  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0912116  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2290  hypothetical protein  34.78 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0168  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3371  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  37.93 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 68 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2282  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.545722  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1361  EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)  35.29 
 
 		 516 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419571  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0035  XRE family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 853 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2017  Cro/CI family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 429 aa  40.8  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.744887  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5380  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5481  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1136  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>