32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4412 on replicon NC_008537
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008537  Arth_4412  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 183 aa  368  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0919942  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2260  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03585  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  51.02 
 
 		 77 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3371  helix-turn-helix domain-containing protein  39.51 
 
 		 88 aa  49.7  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0510  XRE family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 89 aa  49.3  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5678  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 90 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.669501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0830  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.0000289664  hitchhiker  0.0000066158 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1196  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 		 75 aa  45.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.151247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  41.51 
 
 		 126 aa  45.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 68 aa  44.7  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  42.31 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1918  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 310 aa  43.9  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 69 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0572  cupin 2 domain-containing protein  40.38 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1833  transcriptional regulator  40.38 
 
 		 65 aa  42.7  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000852884  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2033  hypothetical protein  36.54 
 
 		 64 aa  42.4  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02797  helix-turn-helix, putative  42.31 
 
 		 62 aa  42.4  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2426  hypothetical protein  37.74 
 
 		 75 aa  42  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0631  hypothetical protein  44.44 
 
 		 73 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1776  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 79 aa  41.6  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0912116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0291  helix-turn-helix domain protein  40.38 
 
 		 92 aa  41.6  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03640  predicted transcriptional regulator  46.94 
 
 		 98 aa  41.2  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  38 
 
 		 68 aa  41.2  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0197  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 80 aa  41.2  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243983  normal  0.255658 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  22.98 
 
 		 200 aa  41.2  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  35.19 
 
 		 67 aa  41.2  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11150  putative transcriptional regulator  46.15 
 
 		 68 aa  41.2  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00242881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5696  XRE family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 66 aa  40.8  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2889  DNA-binding protein  35.85 
 
 		 223 aa  40.8  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0152  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 93 aa  40.8  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>