45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03640 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_03640  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 98 aa  194  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1225  transcriptional regulator, XRE family  54.76 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1757  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.489894  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2883  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20520  DNA binding protein, XRE family  43.33 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  52.78 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 513 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 91 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08690  Helix-turn-helix protein  35.62 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176489 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  34.15 
 
 		 126 aa  43.5  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2962  hypothetical protein  41.94 
 
 		 476 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0436229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0049  XRE family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 220 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1629  XRE family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 66 aa  42.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1150  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  43.9 
 
 		 230 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000248041  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7007  transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 110 aa  42  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03585  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2644  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 474 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 72 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  35.71 
 
 		 217 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  35.71 
 
 		 217 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  35.71 
 
 		 217 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3385  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4412  XRE family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 183 aa  41.2  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0919942  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4462  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4519  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4441  transcriptional regulator, XRE family  29.23 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 189 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  43.4 
 
 		 187 aa  40.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  47.37 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  38.98 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  47.37 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  47.37 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  47.37 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  47.37 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3420  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.964582 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  47.37 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  44.19 
 
 		 80 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0820  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 79 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0102782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  52.63 
 
 		 79 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2818  transcriptional regulator, XRE family  44.19 
 
 		 173 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>