36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2883 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2883  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 71 aa  134  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1136  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1757  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.489894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08690  Helix-turn-helix protein  53.33 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176489 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0510  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03585  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 206 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1274  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 212 aa  47  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03640  predicted transcriptional regulator  37.68 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1080  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6085  transcriptional regulator, XRE family  35.38 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2282  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.545722  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3420  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.964582 
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  39.34 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  39.34 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  39.34 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0789  HipB domain-containing protein  36.36 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107176  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 252 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  46.67 
 
 		 196 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1458  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  40.32 
 
 		 264 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2003  HipB domain-containing protein  33.33 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0681  putative transcriptionl regulator HipB  33.33 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1911  putative transcription regulator protein  33.87 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1592  HipB domain-containing protein  33.33 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3096  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 192 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00124629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2236  putative transcriptionl regulator HipB  33.33 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.74282  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2151  putative transcriptionl regulator HipB  33.33 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4849  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 216 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2260  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0634  HipB domain-containing protein  33.33 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29949  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1225  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 105 aa  40  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>