More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2293 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  360  5.0000000000000005e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1574  XRE family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.844747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0538  XRE family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0512  XRE family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 185 aa  104  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1291  XRE family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0600797  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  35.91 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 180 aa  92.8  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0868  transcriptional regulator, XRE family  36.93 
 
 		 179 aa  91.3  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0952  XRE family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0264927 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2743  transcriptional regulator, XRE family  33.71 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3354  transcriptional regulator, XRE family  33.15 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.604997  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1565  transcriptional regulator, XRE family  33.52 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3846  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.17 
 
 		 459 aa  75.1  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.692652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3846  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.28 
 
 		 459 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.28 
 
 		 459 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  36.28 
 
 		 459 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  34.78 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  33.63 
 
 		 463 aa  61.6  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  33.03 
 
 		 454 aa  57  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0544  XRE family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  34.17 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  30.1 
 
 		 315 aa  55.1  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1922  CBS domain containing membrane protein  24.48 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  29.23 
 
 		 295 aa  53.9  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  27.27 
 
 		 132 aa  52.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2679  signal-transduction protein  23.58 
 
 		 146 aa  52.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.136192 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  29.87 
 
 		 286 aa  52.8  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 394 aa  52  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  28.48 
 
 		 909 aa  51.2  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  26.09 
 
 		 286 aa  51.2  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  34.17 
 
 		 155 aa  51.2  0.000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 93 aa  50.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0438  KpsF/GutQ family protein  36.36 
 
 		 326 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.181851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.61 
 
 		 243 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  26.9 
 
 		 228 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  26.57 
 
 		 391 aa  50.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 252 aa  49.7  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  32.46 
 
 		 379 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  29.69 
 
 		 230 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  27.78 
 
 		 230 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  26.01 
 
 		 500 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  30.08 
 
 		 640 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  28.83 
 
 		 462 aa  49.3  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  27.69 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 134 aa  48.9  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  27.19 
 
 		 460 aa  48.9  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3931  transcriptional regulator, XRE family  48.98 
 
 		 253 aa  48.5  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10830  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 64 aa  48.5  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.213201  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4679  putative transcriptional regulator  45.65 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  33.33 
 
 		 465 aa  48.5  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  30.48 
 
 		 313 aa  48.1  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2239  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  34.62 
 
 		 368 aa  48.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  29.46 
 
 		 133 aa  48.1  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  29.13 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 208 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 208 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 208 aa  48.1  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  44.68 
 
 		 182 aa  48.1  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  29.13 
 
 		 211 aa  47.8  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2208  XRE family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 73 aa  47.8  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0421873 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2218  XRE family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 68 aa  47.8  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 		 182 aa  47.8  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 77 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0404  KpsF/GutQ family protein  34.65 
 
 		 323 aa  47.8  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.126623 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  25.93 
 
 		 423 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 300 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2087  XRE family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 195 aa  47  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  30.43 
 
 		 380 aa  47.4  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0943  cystathionine beta-synthase  29.2 
 
 		 454 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  26.61 
 
 		 243 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  25.14 
 
 		 366 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  42.55 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  27.59 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0105  DNA-binding protein  44.44 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  42.55 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0238  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.71 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1598  helix-turn-helix domain-containing protein  45.83 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.141613 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  42.55 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  25.7 
 
 		 366 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0568  transcriptional regulator, XRE family  45.24 
 
 		 304 aa  46.2  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.415819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  32.99 
 
 		 464 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0718  transcriptional regulator, XRE family  27.97 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.439384  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  25.74 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  23.19 
 
 		 232 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  29.25 
 
 		 468 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  25.55 
 
 		 223 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5523  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  45.65 
 
 		 256 aa  46.2  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3261  XRE family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 190 aa  45.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.957848  normal  0.179215 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  32.69 
 
 		 291 aa  45.8  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0152  XRE family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 93 aa  45.8  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>