67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0634 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0634  HipB domain-containing protein  100 
 
 		 136 aa  265  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29949  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2151  putative transcriptionl regulator HipB  99.26 
 
 		 136 aa  263  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.690845  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2236  putative transcriptionl regulator HipB  99.26 
 
 		 136 aa  263  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.74282  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1592  HipB domain-containing protein  93.38 
 
 		 134 aa  209  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0681  putative transcriptionl regulator HipB  93.38 
 
 		 134 aa  209  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2003  HipB domain-containing protein  93.38 
 
 		 134 aa  209  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0789  HipB domain-containing protein  85.71 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107176  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5530  XRE family transcriptional regulator  65.06 
 
 		 162 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0171722 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1365  XRE family transcriptional regulator  73.24 
 
 		 173 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.927865 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4224  XRE family transcriptional regulator  57.84 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5958  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1622  XRE family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00320147  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4397  XRE family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 135 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3970  XRE family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 135 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4276  XRE family transcriptional regulator  70.31 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3808  XRE family transcriptional regulator  70.31 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3701  transcriptional regulator, XRE family  64.18 
 
 		 101 aa  92  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4813  putative transcriptionl regulator HipB  61.19 
 
 		 101 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3331  putative transcription regulator protein  53.73 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0094  transcriptional regulator, XRE family  46.97 
 
 		 85 aa  63.5  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.850445  normal  0.0181777 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0338  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  46.27 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4519  XRE family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2577  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0918178  hitchhiker  0.000133769 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2611  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0796411  hitchhiker  0.0000000000000114 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1915  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.799088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0306  transciptional regulator  44.07 
 
 		 93 aa  55.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93162  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0367  XRE family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0365  helix-turn-helix domain-containing protein  44.07 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  44.07 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4613  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 89 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.590277  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0496  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3946  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.68 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4032  helix-turn-helix domain protein  42.11 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.964235  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3847  helix-turn-helix domain-containing protein  40.68 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2034  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.194194 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  31.58 
 
 		 94 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6085  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 85 aa  50.4  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  35.59 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  35.59 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  35.59 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  35.59 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1447  putative transcription regulator protein  44.07 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4245  helix-turn-helix domain protein  37.29 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1801  DNA-binding transcriptional regulator HipB  37.29 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 513 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003247  putative transcription regulator protein  37.29 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0567  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 82 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.102591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5634  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909222  normal  0.150315 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2898  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  39.71 
 
 		 465 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0143  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 825 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.514651 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0935  hypothetical protein  32.14 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1635  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0065  hypothetical protein  30.91 
 
 		 79 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2922  transcriptional regulator, XRE family  52.5 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.562834  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  35.38 
 
 		 227 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 208 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 208 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 208 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3420  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.964582 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  38.98 
 
 		 517 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0169  Cro/CI family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0106537  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1542  hypothetical protein  30.51 
 
 		 102 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>