37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1225 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1225  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 88 aa  172  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03640  predicted transcriptional regulator  54.76 
 
 		 98 aa  95.5  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03585  transcriptional regulator  49.25 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4519  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2822  transcriptional regulator, XRE family  61.54 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00025519  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  46.51 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1757  transcriptional regulator, XRE family  45.59 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.489894  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1150  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  41.07 
 
 		 230 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000248041  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1409  transcriptional regulator, XRE family  58.97 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.503834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1247  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3964  XRE family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934118  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3860  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  53.85 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08690  Helix-turn-helix protein  37.1 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176489 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2894  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 83 aa  42  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4362  XRE family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 69 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 131 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  48.72 
 
 		 81 aa  42  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5258  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0039  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 377 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1223  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  38.71 
 
 		 316 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117145  normal  0.0124179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2282  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.545722  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5848  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 176 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4462  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1983  transcriptional regulator, XRE family  55.88 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.418857  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0037  hypothetical protein  62.5 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0207  transcriptional regulator, XRE family  51.28 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000425004  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4364  transcriptional regulator protein-like protein  62.5 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2883  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  54.55 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  43.9 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1931  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  56.25 
 
 		 352 aa  40  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.584244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>