30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1918 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1918  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 310 aa  608  1e-173  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1725  helix-turn-helix domain-containing protein  44.81 
 
 		 299 aa  248  9e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1687  helix-turn-helix domain-containing protein  37.86 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0143591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  29.44 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1988  helix-turn-helix domain-containing protein  25.94 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0682  XRE family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  37.61 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.519248  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1655  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 251 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00837967 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0210  hypothetical protein  32.52 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1514  hypothetical protein  33.55 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1702  hypothetical protein  27.02 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.49535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0898  hypothetical protein  32.67 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1446  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.952233  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0277  hypothetical protein  35.63 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0160  hypothetical protein  30.6 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2347  helix-turn-helix domain-containing protein  26.88 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0273  hypothetical protein  31.9 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.685946 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1331  transcriptional regulator, XRE family  38.96 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0031  transcriptional regulator, XRE family  29.08 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1789  hypothetical protein  41.1 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2548  XRE family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.267127 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0846  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2425  transcriptional regulator, XRE family  34.12 
 
 		 323 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2318  hypothetical protein  36.36 
 
 		 327 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1177  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 321 aa  50.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  31.11 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1811  hypothetical protein  26.34 
 
 		 323 aa  46.2  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 224 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 118 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4412  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 183 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0919942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>