27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1988 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1988  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 249 aa  505  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0682  XRE family transcriptional regulator  60.73 
 
 		 249 aa  315  3e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1655  XRE family transcriptional regulator  55.2 
 
 		 251 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00837967 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  57.96 
 
 		 248 aa  299  3e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1687  helix-turn-helix domain-containing protein  34.39 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0143591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0160  hypothetical protein  29.07 
 
 		 317 aa  93.2  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2318  hypothetical protein  29.03 
 
 		 327 aa  91.3  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1811  hypothetical protein  31.48 
 
 		 323 aa  88.6  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  30.73 
 
 		 317 aa  86.7  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2347  helix-turn-helix domain-containing protein  32.56 
 
 		 304 aa  85.9  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0273  hypothetical protein  31.48 
 
 		 323 aa  85.5  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.685946 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0031  transcriptional regulator, XRE family  31.48 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2548  XRE family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.267127 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1177  transcriptional regulator, XRE family  31.1 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1446  XRE family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.952233  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1918  transcriptional regulator, XRE family  25.94 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1702  hypothetical protein  26.51 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.49535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0210  hypothetical protein  25.9 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2425  transcriptional regulator, XRE family  29.88 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0846  transcriptional regulator, XRE family  31.32 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1789  hypothetical protein  29.7 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0898  hypothetical protein  25.9 
 
 		 326 aa  75.5  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1514  hypothetical protein  26.52 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1725  helix-turn-helix domain-containing protein  22.71 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1331  transcriptional regulator, XRE family  25.23 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  27.63 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.519248  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0277  hypothetical protein  26.22 
 
 		 336 aa  68.9  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>