35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1177 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1177  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
321 aa  644    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2425  transcriptional regulator, XRE family  90.4 
 
 
323 aa  559  1e-158  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1789  hypothetical protein  72.1 
 
 
321 aa  471  1e-132  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0846  transcriptional regulator, XRE family  72.73 
 
 
322 aa  460  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0273  hypothetical protein  70.75 
 
 
323 aa  458  9.999999999999999e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.685946 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2318  hypothetical protein  43.9 
 
 
327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1811  hypothetical protein  43.37 
 
 
323 aa  279  5e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2347  helix-turn-helix domain-containing protein  40.76 
 
 
304 aa  233  3e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1446  XRE family transcriptional regulator  42.45 
 
 
334 aa  221  9e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.952233  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0031  transcriptional regulator, XRE family  37.66 
 
 
303 aa  219  7e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2548  XRE family transcriptional regulator  38.14 
 
 
306 aa  217  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.267127 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0160  hypothetical protein  37.42 
 
 
317 aa  211  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1331  transcriptional regulator, XRE family  37.78 
 
 
308 aa  209  6e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  34.71 
 
 
317 aa  194  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1514  hypothetical protein  29.66 
 
 
327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0898  hypothetical protein  30.18 
 
 
326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0210  hypothetical protein  28.36 
 
 
327 aa  139  7e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1702  hypothetical protein  28.48 
 
 
326 aa  138  1e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.49535  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0277  hypothetical protein  27.93 
 
 
336 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  33.11 
 
 
297 aa  92  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.519248  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1988  helix-turn-helix domain-containing protein  31.1 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 
248 aa  77  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1725  helix-turn-helix domain-containing protein  27.96 
 
 
299 aa  68.9  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0682  XRE family transcriptional regulator  29.63 
 
 
249 aa  65.9  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539242  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1655  XRE family transcriptional regulator  27.44 
 
 
251 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00837967 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1687  helix-turn-helix domain-containing protein  35.25 
 
 
264 aa  60.8  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0143591  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1918  transcriptional regulator, XRE family  23.59 
 
 
310 aa  53.1  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  52.08 
 
 
149 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  46.15 
 
 
149 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
149 aa  49.3  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  50 
 
 
149 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  50 
 
 
149 aa  49.3  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  46.15 
 
 
149 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  47.27 
 
 
143 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  50 
 
 
92 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>