28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1331 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1331  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 308 aa  603  9.999999999999999e-173  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1177  transcriptional regulator, XRE family  35.98 
 
 		 321 aa  203  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2425  transcriptional regulator, XRE family  33.94 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1811  hypothetical protein  36.59 
 
 		 323 aa  185  7e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0273  hypothetical protein  34.7 
 
 		 323 aa  185  8e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.685946 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1789  hypothetical protein  37.8 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2318  hypothetical protein  35 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0846  transcriptional regulator, XRE family  34.71 
 
 		 322 aa  176  6e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2347  helix-turn-helix domain-containing protein  33.44 
 
 		 304 aa  168  9e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0898  hypothetical protein  35.03 
 
 		 326 aa  165  8e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0210  hypothetical protein  35.03 
 
 		 327 aa  165  8e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1702  hypothetical protein  35.03 
 
 		 326 aa  165  9e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.49535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  32.4 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1446  XRE family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 334 aa  159  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.952233  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2548  XRE family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 306 aa  158  9e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.267127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0031  transcriptional regulator, XRE family  32.23 
 
 		 303 aa  152  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0160  hypothetical protein  30.7 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1514  hypothetical protein  32.88 
 
 		 327 aa  149  6e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0277  hypothetical protein  33.87 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  34.97 
 
 		 297 aa  98.2  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.519248  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1687  helix-turn-helix domain-containing protein  29.51 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0143591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1988  helix-turn-helix domain-containing protein  25.23 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  27.12 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0682  XRE family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1655  XRE family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 251 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00837967 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1918  transcriptional regulator, XRE family  38.96 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1725  helix-turn-helix domain-containing protein  26.39 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 189 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>