30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0378 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 297 aa  588  1e-167  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.519248  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1331  transcriptional regulator, XRE family  34.97 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  32.23 
 
 		 317 aa  97.1  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1811  hypothetical protein  36.81 
 
 		 323 aa  96.3  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0846  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1446  XRE family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 334 aa  93.2  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.952233  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1177  transcriptional regulator, XRE family  33.11 
 
 		 321 aa  90.9  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1789  hypothetical protein  38.28 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2425  transcriptional regulator, XRE family  36.72 
 
 		 323 aa  90.9  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0273  hypothetical protein  35.94 
 
 		 323 aa  90.5  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.685946 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0277  hypothetical protein  33.14 
 
 		 336 aa  89.4  6e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0160  hypothetical protein  33.92 
 
 		 317 aa  87  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0031  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 303 aa  86.7  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2347  helix-turn-helix domain-containing protein  36.57 
 
 		 304 aa  86.7  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2548  XRE family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.267127 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1725  helix-turn-helix domain-containing protein  32.39 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1514  hypothetical protein  30.33 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0898  hypothetical protein  26.62 
 
 		 326 aa  82.4  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1702  hypothetical protein  29.38 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.49535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0210  hypothetical protein  28.91 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  31.79 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0682  XRE family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2318  hypothetical protein  32.06 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1655  XRE family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00837967 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1918  transcriptional regulator, XRE family  37.61 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1687  helix-turn-helix domain-containing protein  33.86 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0143591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1988  helix-turn-helix domain-containing protein  27.63 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 118 aa  47  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 72 aa  42.4  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0707  helix-turn-helix domain-containing protein  37.88 
 
 		 134 aa  42.4  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.866911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>