34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0195 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 317 aa  642    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2347  helix-turn-helix domain-containing protein  59.74 
 
 		 304 aa  378  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0031  transcriptional regulator, XRE family  63.61 
 
 		 303 aa  380  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2548  XRE family transcriptional regulator  60.32 
 
 		 306 aa  375  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.267127 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0160  hypothetical protein  54.95 
 
 		 317 aa  342  5e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1811  hypothetical protein  39.03 
 
 		 323 aa  215  9e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2318  hypothetical protein  37.85 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1446  XRE family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.952233  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0846  transcriptional regulator, XRE family  34.69 
 
 		 322 aa  190  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0273  hypothetical protein  33.95 
 
 		 323 aa  189  5e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.685946 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1177  transcriptional regulator, XRE family  34.19 
 
 		 321 aa  185  8e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2425  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1789  hypothetical protein  32.3 
 
 		 321 aa  176  5e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1331  transcriptional regulator, XRE family  32.4 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0210  hypothetical protein  33.67 
 
 		 327 aa  149  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0277  hypothetical protein  28.18 
 
 		 336 aa  149  8e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1702  hypothetical protein  33.33 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.49535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0898  hypothetical protein  32.99 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1514  hypothetical protein  32.39 
 
 		 327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  32.23 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.519248  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1988  helix-turn-helix domain-containing protein  30.73 
 
 		 249 aa  86.7  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1655  XRE family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00837967 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  31.1 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0682  XRE family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 249 aa  79  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1687  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0143591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1725  helix-turn-helix domain-containing protein  31.41 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 224 aa  49.3  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1983  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 64 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.418857  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1918  transcriptional regulator, XRE family  31.11 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 72 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  29.93 
 
 		 208 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  32.05 
 
 		 149 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5366  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 65 aa  42.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53351  normal  0.352058 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  30.23 
 
 		 206 aa  42.4  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>