42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0210 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0210  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  652    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1702  hypothetical protein  98.15 
 
 		 326 aa  639    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.49535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0898  hypothetical protein  98.15 
 
 		 326 aa  635    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1514  hypothetical protein  82.87 
 
 		 327 aa  551  1e-156  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0277  hypothetical protein  53.57 
 
 		 336 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1811  hypothetical protein  32.22 
 
 		 323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1331  transcriptional regulator, XRE family  35.03 
 
 		 308 aa  165  8e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2318  hypothetical protein  32.84 
 
 		 327 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0160  hypothetical protein  34.87 
 
 		 317 aa  152  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1789  hypothetical protein  30.7 
 
 		 321 aa  149  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  33.67 
 
 		 317 aa  149  6e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0031  transcriptional regulator, XRE family  34.59 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1446  XRE family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 334 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.952233  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2548  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.267127 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0273  hypothetical protein  30.24 
 
 		 323 aa  142  6e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.685946 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2347  helix-turn-helix domain-containing protein  33.45 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0846  transcriptional regulator, XRE family  29.22 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2425  transcriptional regulator, XRE family  27.46 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1177  transcriptional regulator, XRE family  28.66 
 
 		 321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1655  XRE family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 251 aa  99.4  8e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00837967 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  32.53 
 
 		 248 aa  93.2  6e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1687  helix-turn-helix domain-containing protein  35.88 
 
 		 264 aa  87  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0143591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1725  helix-turn-helix domain-containing protein  32.75 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  28.91 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.519248  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1988  helix-turn-helix domain-containing protein  25.9 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0682  XRE family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539242  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1918  transcriptional regulator, XRE family  32.52 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 190 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 190 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 190 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 190 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 190 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 190 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 190 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 190 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 190 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4776  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 111 aa  43.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0811435  normal  0.544838 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 190 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  25.6 
 
 		 269 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 72 aa  42.7  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 115 aa  42.7  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 115 aa  42.7  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>