30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1446 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1446  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 334 aa  662    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.952233  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2318  hypothetical protein  47.99 
 
 		 327 aa  300  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1811  hypothetical protein  47.78 
 
 		 323 aa  291  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0846  transcriptional regulator, XRE family  44.97 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1177  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 321 aa  237  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0031  transcriptional regulator, XRE family  42.95 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1789  hypothetical protein  40.87 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0273  hypothetical protein  39.63 
 
 		 323 aa  233  3e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.685946 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2425  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 323 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2548  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 306 aa  228  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.267127 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0160  hypothetical protein  39.37 
 
 		 317 aa  219  6e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  39.26 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2347  helix-turn-helix domain-containing protein  37.17 
 
 		 304 aa  207  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1331  transcriptional regulator, XRE family  36.74 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0898  hypothetical protein  31.63 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1514  hypothetical protein  31.42 
 
 		 327 aa  159  8e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1702  hypothetical protein  31.63 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.49535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0210  hypothetical protein  31.42 
 
 		 327 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0277  hypothetical protein  28.2 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1655  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 251 aa  99.8  5e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00837967 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  34.57 
 
 		 248 aa  98.2  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  36.49 
 
 		 297 aa  93.6  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.519248  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0682  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 249 aa  91.7  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1988  helix-turn-helix domain-containing protein  26.69 
 
 		 249 aa  86.7  6e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1687  helix-turn-helix domain-containing protein  33.79 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0143591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1725  helix-turn-helix domain-containing protein  31.01 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1918  transcriptional regulator, XRE family  28.89 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3527  transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 178 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00697962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 		 176 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 244 aa  42.7  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>