34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0846 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0846  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 
322 aa  639    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1789  hypothetical protein  73.12 
 
 
321 aa  478  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2425  transcriptional regulator, XRE family  73.83 
 
 
323 aa  462  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1177  transcriptional regulator, XRE family  72.73 
 
 
321 aa  456  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0273  hypothetical protein  68.32 
 
 
323 aa  441  1e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.685946 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1811  hypothetical protein  44 
 
 
323 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2318  hypothetical protein  43.77 
 
 
327 aa  270  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1446  XRE family transcriptional regulator  45.28 
 
 
334 aa  227  2e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.952233  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2347  helix-turn-helix domain-containing protein  37.97 
 
 
304 aa  219  5e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2548  XRE family transcriptional regulator  38.22 
 
 
306 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.267127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0031  transcriptional regulator, XRE family  36.42 
 
 
303 aa  207  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0160  hypothetical protein  35.69 
 
 
317 aa  202  4e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  34.69 
 
 
317 aa  194  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1331  transcriptional regulator, XRE family  35.35 
 
 
308 aa  182  8.000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0277  hypothetical protein  29.2 
 
 
336 aa  154  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0210  hypothetical protein  29.82 
 
 
327 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0898  hypothetical protein  30.46 
 
 
326 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1702  hypothetical protein  29.94 
 
 
326 aa  142  7e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.49535  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1514  hypothetical protein  30.09 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 
297 aa  94.4  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.519248  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  31.48 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1988  helix-turn-helix domain-containing protein  31.32 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1687  helix-turn-helix domain-containing protein  33.52 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0143591  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1655  XRE family transcriptional regulator  30.07 
 
 
251 aa  67  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00837967 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0682  XRE family transcriptional regulator  26.96 
 
 
249 aa  63.9  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539242  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1725  helix-turn-helix domain-containing protein  43.08 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1918  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
310 aa  52.8  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  42.11 
 
 
149 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  45.28 
 
 
149 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  43.4 
 
 
149 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 
149 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  43.4 
 
 
149 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  43.4 
 
 
149 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  43.4 
 
 
92 aa  42.7  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>