33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1514 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1514  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  651    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0210  hypothetical protein  82.87 
 
 		 327 aa  551  1e-156  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1702  hypothetical protein  82.72 
 
 		 326 aa  548  1e-155  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.49535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0898  hypothetical protein  82.72 
 
 		 326 aa  544  1e-154  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0277  hypothetical protein  56.05 
 
 		 336 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1811  hypothetical protein  31.12 
 
 		 323 aa  162  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2318  hypothetical protein  32.45 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1331  transcriptional regulator, XRE family  32.88 
 
 		 308 aa  149  7e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  32.39 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2347  helix-turn-helix domain-containing protein  34.81 
 
 		 304 aa  146  6e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1446  XRE family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 334 aa  145  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.952233  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0031  transcriptional regulator, XRE family  36.15 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2425  transcriptional regulator, XRE family  29.52 
 
 		 323 aa  142  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0273  hypothetical protein  30.24 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.685946 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2548  XRE family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 306 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.267127 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1177  transcriptional regulator, XRE family  29.52 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0160  hypothetical protein  33.99 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1789  hypothetical protein  29.87 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0846  transcriptional regulator, XRE family  29.18 
 
 		 322 aa  134  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1655  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 251 aa  94  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00837967 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  32.53 
 
 		 248 aa  92.4  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  30.33 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.519248  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1687  helix-turn-helix domain-containing protein  33.59 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0143591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1988  helix-turn-helix domain-containing protein  26.52 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1725  helix-turn-helix domain-containing protein  29.82 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1918  transcriptional regulator, XRE family  33.55 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0682  XRE family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 249 aa  67  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 105 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4776  transcriptional regulator, XRE family  42.25 
 
 		 111 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0811435  normal  0.544838 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4933  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 209 aa  43.1  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4469  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 209 aa  43.1  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4983  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 209 aa  43.1  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0953387  normal  0.300371 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05910  predicted transcriptional regulator  28.72 
 
 		 190 aa  42.4  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.848221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>