43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0898 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0210  hypothetical protein  98.15 
 
 		 327 aa  635    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1702  hypothetical protein  97.85 
 
 		 326 aa  639    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.49535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0898  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  652    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1514  hypothetical protein  82.72 
 
 		 327 aa  544  1e-154  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0277  hypothetical protein  53.27 
 
 		 336 aa  355  5e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1331  transcriptional regulator, XRE family  35.03 
 
 		 308 aa  165  9e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1811  hypothetical protein  31.93 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2318  hypothetical protein  32.74 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0160  hypothetical protein  35.53 
 
 		 317 aa  151  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1789  hypothetical protein  30.4 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0031  transcriptional regulator, XRE family  34.59 
 
 		 303 aa  150  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  32.99 
 
 		 317 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1446  XRE family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.952233  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2548  XRE family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 306 aa  145  9e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.267127 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2347  helix-turn-helix domain-containing protein  33.45 
 
 		 304 aa  142  5e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0273  hypothetical protein  29.94 
 
 		 323 aa  142  6e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.685946 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0846  transcriptional regulator, XRE family  29.85 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2425  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 323 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1177  transcriptional regulator, XRE family  30.49 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1655  XRE family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 251 aa  97.8  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00837967 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  31.93 
 
 		 248 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1687  helix-turn-helix domain-containing protein  35.88 
 
 		 264 aa  85.5  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0143591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  26.62 
 
 		 297 aa  82.4  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.519248  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1725  helix-turn-helix domain-containing protein  32.75 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1988  helix-turn-helix domain-containing protein  25.9 
 
 		 249 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0682  XRE family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539242  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1918  transcriptional regulator, XRE family  32.67 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 190 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 190 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 190 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 190 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 190 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 190 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 190 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 190 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 190 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 190 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4776  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 111 aa  43.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0811435  normal  0.544838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  25.6 
 
 		 269 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 72 aa  42.7  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 115 aa  42.7  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 115 aa  42.7  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  41.82 
 
 		 204 aa  42.7  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>