29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0160 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0160  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  651    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2347  helix-turn-helix domain-containing protein  56.96 
 
 		 304 aa  365  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0031  transcriptional regulator, XRE family  57.37 
 
 		 303 aa  348  7e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  54.95 
 
 		 317 aa  342  5e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2548  XRE family transcriptional regulator  49.69 
 
 		 306 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.267127 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1446  XRE family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 334 aa  209  6e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.952233  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2318  hypothetical protein  35.69 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1811  hypothetical protein  37.07 
 
 		 323 aa  203  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1789  hypothetical protein  35.62 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1177  transcriptional regulator, XRE family  37.42 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0846  transcriptional regulator, XRE family  34.59 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0273  hypothetical protein  33.12 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.685946 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2425  transcriptional regulator, XRE family  36.25 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1702  hypothetical protein  35.2 
 
 		 326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.49535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0210  hypothetical protein  34.87 
 
 		 327 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1331  transcriptional regulator, XRE family  30.7 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0898  hypothetical protein  35.53 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1514  hypothetical protein  33.99 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0277  hypothetical protein  30.16 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1988  helix-turn-helix domain-containing protein  29.07 
 
 		 249 aa  93.2  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1655  XRE family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 251 aa  90.1  5e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00837967 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  33.92 
 
 		 297 aa  87  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.519248  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  26.67 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0682  XRE family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1687  helix-turn-helix domain-containing protein  34.46 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0143591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1725  helix-turn-helix domain-containing protein  26.37 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1918  transcriptional regulator, XRE family  30.6 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 224 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 71 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>