29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1725 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1725  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 299 aa  591  1e-168  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1918  transcriptional regulator, XRE family  44.81 
 
 		 310 aa  248  9e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0682  XRE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  32.39 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.519248  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0210  hypothetical protein  32.75 
 
 		 327 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1655  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 251 aa  82  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00837967 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1702  hypothetical protein  32.75 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.49535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0277  hypothetical protein  24.67 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0898  hypothetical protein  32.75 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1514  hypothetical protein  29.82 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1687  helix-turn-helix domain-containing protein  27.07 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0143591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1988  helix-turn-helix domain-containing protein  22.71 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2318  hypothetical protein  26.11 
 
 		 327 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1789  hypothetical protein  37.29 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0031  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  31.41 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0273  hypothetical protein  35.04 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.685946 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  27.56 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2347  helix-turn-helix domain-containing protein  29.03 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1811  hypothetical protein  25.84 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1446  XRE family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.952233  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2425  transcriptional regulator, XRE family  26.69 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0160  hypothetical protein  26.37 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1177  transcriptional regulator, XRE family  28.32 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2548  XRE family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.267127 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1331  transcriptional regulator, XRE family  26.39 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0846  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1497  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 71 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.764708  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5088  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 167 aa  42.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000165067  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>