33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1655 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1655  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 251 aa  504  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00837967 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0682  XRE family transcriptional regulator  68 
 
 		 249 aa  353  1e-96  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  57.09 
 
 		 248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1988  helix-turn-helix domain-containing protein  55.2 
 
 		 249 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1687  helix-turn-helix domain-containing protein  33.05 
 
 		 264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0143591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0210  hypothetical protein  34.88 
 
 		 327 aa  99.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1702  hypothetical protein  34.88 
 
 		 326 aa  99.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.49535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0898  hypothetical protein  34.3 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1514  hypothetical protein  32.76 
 
 		 327 aa  94  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0277  hypothetical protein  32.53 
 
 		 336 aa  94.4  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1446  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 334 aa  92.4  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.952233  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0160  hypothetical protein  32.72 
 
 		 317 aa  90.1  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0031  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 303 aa  87.8  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  31.98 
 
 		 317 aa  85.1  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2347  helix-turn-helix domain-containing protein  32.72 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1811  hypothetical protein  27.78 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1725  helix-turn-helix domain-containing protein  32.93 
 
 		 299 aa  82  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2548  XRE family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 306 aa  75.5  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.267127 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  29.7 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.519248  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0273  hypothetical protein  30.25 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.685946 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1918  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 310 aa  72  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2318  hypothetical protein  24.07 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1789  hypothetical protein  27 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0846  transcriptional regulator, XRE family  30.07 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1177  transcriptional regulator, XRE family  27.44 
 
 		 321 aa  62  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1331  transcriptional regulator, XRE family  27.81 
 
 		 308 aa  62  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2425  transcriptional regulator, XRE family  27.45 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0981  DNA-binding protein  34.78 
 
 		 183 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1088  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 183 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0501  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 68 aa  44.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.60564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7925  putative transcriptional regulator, XRE family  30.17 
 
 		 199 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6405  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 189 aa  42  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146143  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02797  helix-turn-helix, putative  37.5 
 
 		 62 aa  42  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>