35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2548 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2548  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  619  1e-176  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.267127 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  60.32 
 
 		 317 aa  375  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0031  transcriptional regulator, XRE family  57.65 
 
 		 303 aa  358  6e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2347  helix-turn-helix domain-containing protein  53.62 
 
 		 304 aa  345  4e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0160  hypothetical protein  49.69 
 
 		 317 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1446  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 334 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.952233  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2318  hypothetical protein  36.48 
 
 		 327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1811  hypothetical protein  38.22 
 
 		 323 aa  210  3e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0846  transcriptional regulator, XRE family  36.94 
 
 		 322 aa  208  7e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1177  transcriptional regulator, XRE family  37.18 
 
 		 321 aa  206  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0273  hypothetical protein  35.46 
 
 		 323 aa  202  4e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.685946 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2425  transcriptional regulator, XRE family  35.67 
 
 		 323 aa  202  7e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1789  hypothetical protein  35.99 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1331  transcriptional regulator, XRE family  35.74 
 
 		 308 aa  158  9e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0898  hypothetical protein  31.02 
 
 		 326 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0210  hypothetical protein  31.03 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1702  hypothetical protein  30.41 
 
 		 326 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.49535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1514  hypothetical protein  28.26 
 
 		 327 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0277  hypothetical protein  28.79 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  34.93 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.519248  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1988  helix-turn-helix domain-containing protein  29.44 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1687  helix-turn-helix domain-containing protein  34.97 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0143591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1655  XRE family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 251 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00837967 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  30.67 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0682  XRE family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1725  helix-turn-helix domain-containing protein  28.73 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1918  transcriptional regulator, XRE family  27.41 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  31.13 
 
 		 149 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  43.4 
 
 		 149 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 149 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 224 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  29.31 
 
 		 149 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  41.51 
 
 		 149 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  41.51 
 
 		 149 aa  42.7  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  36.11 
 
 		 92 aa  42.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>