28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2318 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2318  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  668    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1811  hypothetical protein  66.67 
 
 		 323 aa  429  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1446  XRE family transcriptional regulator  47.99 
 
 		 334 aa  281  9e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.952233  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1177  transcriptional regulator, XRE family  44.41 
 
 		 321 aa  277  2e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0273  hypothetical protein  43.33 
 
 		 323 aa  271  8.000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.685946 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2425  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 323 aa  271  9e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0846  transcriptional regulator, XRE family  43.47 
 
 		 322 aa  263  3e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1789  hypothetical protein  42.33 
 
 		 321 aa  260  2e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2347  helix-turn-helix domain-containing protein  39.5 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0031  transcriptional regulator, XRE family  38.68 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  37.85 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2548  XRE family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 306 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.267127 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0160  hypothetical protein  35.69 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1331  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 308 aa  181  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0210  hypothetical protein  32.84 
 
 		 327 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0898  hypothetical protein  32.74 
 
 		 326 aa  156  4e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1702  hypothetical protein  32.84 
 
 		 326 aa  156  4e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.49535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1514  hypothetical protein  32.45 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0277  hypothetical protein  26.07 
 
 		 336 aa  129  6e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1988  helix-turn-helix domain-containing protein  29.03 
 
 		 249 aa  91.3  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  27.44 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  32.06 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.519248  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0682  XRE family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1655  XRE family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00837967 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1725  helix-turn-helix domain-containing protein  26.11 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1687  helix-turn-helix domain-containing protein  31.9 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0143591  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1918  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  28.33 
 
 		 143 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>