43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1702 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0210  hypothetical protein  98.15 
 
 
327 aa  639    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1702  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  652    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.49535  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0898  hypothetical protein  97.85 
 
 
326 aa  639    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1514  hypothetical protein  82.72 
 
 
327 aa  548  1e-155  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0277  hypothetical protein  53.27 
 
 
336 aa  355  5e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1811  hypothetical protein  31.93 
 
 
323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1331  transcriptional regulator, XRE family  35.03 
 
 
308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2318  hypothetical protein  32.84 
 
 
327 aa  156  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0160  hypothetical protein  35.2 
 
 
317 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1789  hypothetical protein  30.4 
 
 
321 aa  149  9e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0031  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 
303 aa  147  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1446  XRE family transcriptional regulator  31.63 
 
 
334 aa  145  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.952233  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2548  XRE family transcriptional regulator  30.41 
 
 
306 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.267127 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0273  hypothetical protein  29.85 
 
 
323 aa  144  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.685946 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2347  helix-turn-helix domain-containing protein  33.45 
 
 
304 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0846  transcriptional regulator, XRE family  29.32 
 
 
322 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2425  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 
323 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1177  transcriptional regulator, XRE family  28.79 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1655  XRE family transcriptional regulator  34.88 
 
 
251 aa  99.4  8e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00837967 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  31.33 
 
 
248 aa  92  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1687  helix-turn-helix domain-containing protein  35.88 
 
 
264 aa  86.3  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0143591  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  29.38 
 
 
297 aa  82  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.519248  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1725  helix-turn-helix domain-containing protein  32.75 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1988  helix-turn-helix domain-containing protein  26.51 
 
 
249 aa  77  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0682  XRE family transcriptional regulator  27.81 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539242  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1918  transcriptional regulator, XRE family  27.02 
 
 
310 aa  68.6  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  41.82 
 
 
190 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  41.82 
 
 
190 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 
190 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  41.82 
 
 
190 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  41.82 
 
 
190 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  41.82 
 
 
190 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  41.82 
 
 
190 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  41.82 
 
 
190 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  41.82 
 
 
190 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4776  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 
111 aa  43.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0811435  normal  0.544838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5241  putative transcriptional regulator, XRE family  25.6 
 
 
269 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  41.82 
 
 
190 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 
115 aa  42.7  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 
115 aa  42.7  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 
72 aa  42.4  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  41.82 
 
 
204 aa  42.4  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.855503 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>