34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0277 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0277  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  672    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.672337  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0210  hypothetical protein  53.57 
 
 		 327 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1514  hypothetical protein  56.05 
 
 		 327 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1702  hypothetical protein  53.27 
 
 		 326 aa  355  5e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.49535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0898  hypothetical protein  53.27 
 
 		 326 aa  355  5.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354984  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1789  hypothetical protein  30.5 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0195  helix-turn-helix domain-containing protein  28.18 
 
 		 317 aa  149  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2347  helix-turn-helix domain-containing protein  30.49 
 
 		 304 aa  146  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0846  transcriptional regulator, XRE family  28.19 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2425  transcriptional regulator, XRE family  28.75 
 
 		 323 aa  145  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1811  hypothetical protein  30.29 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0273  hypothetical protein  28.4 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.685946 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2548  XRE family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.267127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0031  transcriptional regulator, XRE family  31.23 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1331  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1446  XRE family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 334 aa  135  8e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.952233  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0160  hypothetical protein  30.16 
 
 		 317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2318  hypothetical protein  26.07 
 
 		 327 aa  129  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1177  transcriptional regulator, XRE family  27.49 
 
 		 321 aa  129  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1655  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 251 aa  94.4  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00837967 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  33.14 
 
 		 297 aa  89.4  8e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.519248  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0596  helix-turn-helix domain-containing protein  33.55 
 
 		 248 aa  89  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1725  helix-turn-helix domain-containing protein  24.67 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1687  helix-turn-helix domain-containing protein  28.74 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0143591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0682  XRE family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 249 aa  79  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1988  helix-turn-helix domain-containing protein  26.22 
 
 		 249 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1918  transcriptional regulator, XRE family  35.63 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  46.2  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05910  predicted transcriptional regulator  36.51 
 
 		 190 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.848221  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2453  XRE family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 175 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.68554  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0162  hypothetical protein  48 
 
 		 64 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03313  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  24.66 
 
 		 175 aa  43.9  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0153  transcriptional regulator  42.59 
 
 		 64 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0023  transcriptional regulator  42.59 
 
 		 87 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>