147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3418 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3418  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 97 aa  183  8e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.961393 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0950  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1055  Xre family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 97 aa  67.4  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2734  XRE family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0752  transcriptional regulator, XRE family  49.3 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596173  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0685  Cro/CI family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 179 aa  50.8  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1158  XRE family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1180  helix-turn-helix domain-containing protein  35.19 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0501  hypothetical protein  37.08 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 198 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0430  helix-turn-helix domain-containing protein  50.94 
 
 		 356 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177138  hitchhiker  0.0000000020389 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5438  XRE family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 184 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2176  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3100  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000473627  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2930  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.372042  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  45.1 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4900  hypothetical protein  44.07 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.978216  normal  0.040659 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1423  transcriptional regulator, XRE family  48.48 
 
 		 195 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1431  helix-turn-helix domain protein  38.27 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0590  XRE family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15000  predicted transcriptional regulator  42.65 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.904149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  46.55 
 
 		 204 aa  45.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  43.24 
 
 		 188 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0740  transcriptional regulator  43.14 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.805789 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1021  transcriptional regulator, XRE family  44.78 
 
 		 191 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.438557  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7007  transcriptional regulator, XRE family  41.79 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 182 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4462  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2429  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 191 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0848952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4544  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 215 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.796901 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  34.94 
 
 		 192 aa  43.9  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0631  hypothetical protein  42.31 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0692  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.782082  normal  0.118291 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  42.19 
 
 		 227 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  37.31 
 
 		 181 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1338  DNA-binding protein  43.18 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2256  Cro/CI family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.033693 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1344  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 258 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.388374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  32.65 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1459  helix-turn-helix domain protein  49.06 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4152  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3482  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.411907  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0954  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1120  DNA-binding protein  44.44 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8704  transcriptional regulator, XRE family  44.78 
 
 		 223 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.264618 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  40.43 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  40.43 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  40.43 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  40.43 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  40.43 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  40.43 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  40.43 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  40.43 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3013  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0143  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  38.33 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1350  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3701  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1149  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0551  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.401249  hitchhiker  0.0000933135 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  38.33 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  40.43 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 111 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 182 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 210 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3725  DNA-binding protein  56.41 
 
 		 258 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3588  DNA-binding protein  32.35 
 
 		 103 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 184 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2319  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 228 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288377  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4003  DNA-binding protein  32.35 
 
 		 103 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1887  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 104 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3722  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 103 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0676164  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0190  transcriptional regulator, XRE family  34.44 
 
 		 112 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4106  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 207 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0938506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  41.18 
 
 		 144 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04780  putative transcription regulator protein  41.51 
 
 		 205 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05657  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  41.51 
 
 		 205 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  38.33 
 
 		 182 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  46.34 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  34.78 
 
 		 188 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0677  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 276 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244102  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3964  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934118  normal  0.368551 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0538  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 202 aa  41.6  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0073  helix-turn-helix domain-containing protein  36.62 
 
 		 210 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 528 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4199  hypothetical protein  37.08 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.335436 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5460  transcriptional regulator, XRE family  48.72 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0289484  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5343  XRE family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.992998 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0476  XRE family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 157 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>