94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2319 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2319  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  444  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288377  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1344  XRE family transcriptional regulator  64.84 
 
 		 258 aa  288  4e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.388374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0677  XRE family transcriptional regulator  64.06 
 
 		 276 aa  276  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244102  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4849  XRE family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2831  hypothetical protein  40 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3183  hypothetical protein  40 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000722228 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4462  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 125 aa  52  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3931  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 112 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5438  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 168 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7007  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 110 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  48.5  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 101 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 321 aa  46.6  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  30.86 
 
 		 245 aa  46.2  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 528 aa  46.2  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 182 aa  46.2  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 256 aa  45.8  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1655  transcriptional regulator, XRE family  42.22 
 
 		 81 aa  45.4  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 111 aa  45.4  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3942  transcriptional regulator, XRE family  35.8 
 
 		 197 aa  45.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  34.12 
 
 		 114 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 115 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5343  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 110 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.992998 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1957  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.210401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0410  putative transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 189 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 77 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04066  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 		 84 aa  45.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2364  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 114 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348863  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4870  XRE family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.523431 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 117 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  24.72 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  24.72 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01190  DNA-binding protein, excisionase family  45.07 
 
 		 164 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3161  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  24.72 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 300 aa  43.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5665  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 156 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1180  helix-turn-helix domain-containing protein  32.73 
 
 		 179 aa  43.5  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  24.72 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2729  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 431 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000809201  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1158  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 179 aa  43.5  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000119717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0887  XRE family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  24.72 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  24.72 
 
 		 190 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4967  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 218 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454469  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  25.61 
 
 		 190 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1558  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 114 aa  43.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  42.62 
 
 		 88 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 97 aa  43.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  25.61 
 
 		 190 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  25.61 
 
 		 190 aa  43.1  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0476  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 157 aa  42.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3418  transcriptional regulator, XRE family  40.54 
 
 		 97 aa  42.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.961393 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  32.73 
 
 		 72 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 198 aa  42.7  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3519  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 71 aa  42.4  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 490 aa  42.4  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0650  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 110 aa  42.4  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3066  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 113 aa  42.4  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.870694  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4938  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 206 aa  42.4  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  25.68 
 
 		 94 aa  42.4  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  32.97 
 
 		 123 aa  42.4  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0950  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 95 aa  42.4  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9055  hypothetical protein  34.18 
 
 		 111 aa  42  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  25.68 
 
 		 88 aa  42.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  25.68 
 
 		 88 aa  42.4  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  25.68 
 
 		 88 aa  42.4  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0925  transcriptional regulator, putative  33.82 
 
 		 182 aa  42.4  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 176 aa  42  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  25.68 
 
 		 88 aa  42.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 188 aa  42  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2636  XRE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 121 aa  42.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0632  DNA-binding protein  38 
 
 		 181 aa  42  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0867  putative transcriptional regulator  33.82 
 
 		 182 aa  42.4  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0318952  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1443  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 182 aa  42  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 182 aa  42  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1247  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 111 aa  42  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 134 aa  42  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  31.15 
 
 		 200 aa  42  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 118 aa  42  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 182 aa  42  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 207 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 105 aa  41.6  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0267  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 99 aa  41.6  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3096  transcriptional regulator, XRE family  25.29 
 
 		 192 aa  41.6  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00124629  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  33.96 
 
 		 91 aa  41.6  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  39.53 
 
 		 72 aa  41.6  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0950  transcriptional regulator, XRE family  29.07 
 
 		 205 aa  41.6  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>