29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2831 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2831  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3183  hypothetical protein  95.02 
 
 		 241 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000722228 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4982  hypothetical protein  58.55 
 
 		 172 aa  188  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42162  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6925  hypothetical protein  55.15 
 
 		 172 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.64306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4809  hypothetical protein  58.78 
 
 		 154 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.758684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6145  hypothetical protein  78.35 
 
 		 144 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4977  hypothetical protein  36.13 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0129  hypothetical protein  32.75 
 
 		 190 aa  72  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0017929  hitchhiker  0.0000435271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2319  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288377  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0677  XRE family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244102  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4849  XRE family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2673  hypothetical protein  41.98 
 
 		 158 aa  57  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1344  XRE family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.388374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3038  hypothetical protein  44.44 
 
 		 160 aa  52.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5020  hypothetical protein  42.31 
 
 		 147 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.788021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12207  hypothetical protein  44.44 
 
 		 168 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3285  hypothetical protein  42.59 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546671 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3336  hypothetical protein  42.59 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215963  normal  0.125579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3274  hypothetical protein  42.59 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3226  hypothetical protein  37.18 
 
 		 183 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000197363  hitchhiker  0.000025689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2970  hypothetical protein  42.59 
 
 		 159 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1393  hypothetical protein  31.63 
 
 		 170 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20125  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3086  hypothetical protein  35.24 
 
 		 176 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3541  hypothetical protein  42.59 
 
 		 163 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.367378  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24810  hypothetical protein  34.52 
 
 		 174 aa  45.8  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.217798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3268  hypothetical protein  38.96 
 
 		 168 aa  45.4  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.200062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5051  hypothetical protein  37.04 
 
 		 169 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.181832 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0020  hypothetical protein  46.3 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3498  hypothetical protein  38.96 
 
 		 180 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.617159  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>