25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_01190 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_01190  DNA-binding protein, excisionase family  100 
 
 		 164 aa  330  7.000000000000001e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10758  transcriptional regulator  52.6 
 
 		 168 aa  168  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.03304e-31  normal  0.354677 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0793  DNA binding domain protein, excisionase family  49.35 
 
 		 178 aa  128  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2993  DNA binding domain protein, excisionase family  56.52 
 
 		 180 aa  47.4  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1031  excisionase/Xis, DNA-binding  44.68 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.126715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5538  DNA binding domain-containing protein  44.68 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0748  excisionase/Xis, DNA-binding  35.59 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.613095 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2639  hypothetical protein  47.62 
 
 		 153 aa  44.3  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690971  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3239  putative excisionase protein  47.62 
 
 		 153 aa  44.3  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0263514 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4162  DNA binding domain-containing protein  48.98 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0766794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1614  excisionase domain protein  47.62 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177236  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0234  DNA binding domain protein, excisionase family  47.62 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.844329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6306  DNA binding domain-containing protein  44.68 
 
 		 64 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2319  XRE family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 228 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288377  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3924  DNA binding domain-containing protein  35.19 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7903  DNA binding domain protein, excisionase family  41.86 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4367  DNA binding domain-containing protein  46.94 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.264021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0047  DNA binding domain, excisionase family  52.08 
 
 		 136 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509276  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3800  DNA binding domain protein, excisionase family  43.9 
 
 		 171 aa  42  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2059  excisionase/Xis, DNA-binding  40 
 
 		 105 aa  42  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4151  excisionase domain-containing protein  47.62 
 
 		 157 aa  42  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3279  DNA binding domain-containing protein  40.91 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.746198  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1737  DNA binding domain protein, excisionase family  47.73 
 
 		 315 aa  40.8  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2344  excisionase/Xis, DNA-binding  43.64 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000412399  unclonable  0.000000144936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1265  DNA binding domain-containing protein  43.64 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>