28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0793 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0793  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 178 aa  354  5e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10758  transcriptional regulator  45.51 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.03304e-31  normal  0.354677 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01190  DNA-binding protein, excisionase family  49.35 
 
 		 164 aa  128  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3239  putative excisionase protein  50 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0263514 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2639  hypothetical protein  40.48 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690971  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0234  DNA binding domain protein, excisionase family  46.67 
 
 		 154 aa  52  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.844329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4367  DNA binding domain-containing protein  52.94 
 
 		 155 aa  52.4  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.264021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0047  DNA binding domain, excisionase family  60 
 
 		 136 aa  52  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509276  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1614  excisionase domain protein  46.67 
 
 		 154 aa  52  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177236  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3800  DNA binding domain protein, excisionase family  38.81 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4162  DNA binding domain-containing protein  47.27 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0766794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2344  excisionase/Xis, DNA-binding  43.66 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000412399  unclonable  0.000000144936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1265  DNA binding domain-containing protein  43.66 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20770  DNA-binding protein, excisionase family  45.45 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3752  DNA binding domain protein, excisionase family  50.98 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4008  DNA binding domain-containing protein  48.78 
 
 		 132 aa  48.1  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3924  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 152 aa  48.1  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3385  DNA binding domain-containing protein  48 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1635  DNA binding domain protein, excisionase family  45.9 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1776  excisionase/Xis, DNA-binding  45.1 
 
 		 97 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.666085  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1445  DNA binding domain protein, excisionase family  42.67 
 
 		 203 aa  45.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04840  DNA-binding protein, excisionase family  45.16 
 
 		 157 aa  46.2  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2993  DNA binding domain protein, excisionase family  51.92 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4151  excisionase domain-containing protein  52.38 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3279  DNA binding domain-containing protein  40 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.746198  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0848  DNA binding domain protein, excisionase family  37.14 
 
 		 127 aa  42  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13782  excisionase  56.76 
 
 		 130 aa  41.6  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.696326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3630  helix-turn-helix domain-containing protein  35.58 
 
 		 172 aa  41.6  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>