35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0848 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0848  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
127 aa  251  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3385  DNA binding domain-containing protein  42.25 
 
 
150 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4162  DNA binding domain-containing protein  31.13 
 
 
155 aa  53.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0766794  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4630  DNA binding domain-containing protein  35.85 
 
 
109 aa  50.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2344  excisionase/Xis, DNA-binding  35.71 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000412399  unclonable  0.000000144936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1265  DNA binding domain-containing protein  35.71 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03470  DNA-binding protein, excisionase family  36.84 
 
 
178 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12334  excisionase  48.15 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3752  DNA binding domain protein, excisionase family  28.3 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0047  DNA binding domain, excisionase family  54.35 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509276  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2639  hypothetical protein  36.99 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690971  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1614  excisionase domain protein  38.71 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177236  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0234  DNA binding domain protein, excisionase family  38.71 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.844329  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3239  putative excisionase protein  34.74 
 
 
153 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0263514 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3800  DNA binding domain protein, excisionase family  35.65 
 
 
171 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4435  DNA binding domain-containing protein  35.62 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.901637  normal  0.560095 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2993  DNA binding domain protein, excisionase family  36.56 
 
 
180 aa  45.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13782  excisionase  37.5 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.696326 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3279  DNA binding domain-containing protein  34.85 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.746198  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4367  DNA binding domain-containing protein  31.43 
 
 
155 aa  43.5  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.264021  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1635  DNA binding domain protein, excisionase family  31.48 
 
 
184 aa  43.5  0.0009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0804  regulatory protein MerR  51.28 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0072  DNA binding domain protein, excisionase family  47.73 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1601  DNA binding domain protein, excisionase family  35.38 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3924  DNA binding domain-containing protein  37.74 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4151  excisionase domain-containing protein  37.5 
 
 
157 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0793  DNA binding domain protein, excisionase family  37.14 
 
 
178 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3464  DNA binding domain protein, excisionase family  31.51 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4008  DNA binding domain-containing protein  34.48 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20770  DNA-binding protein, excisionase family  38.57 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2889  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  44 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4763  excisionase/Xis, DNA-binding  28.83 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6306  DNA binding domain-containing protein  38.98 
 
 
64 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3978  DNA binding domain-containing protein  24.69 
 
 
150 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.382776 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5538  DNA binding domain-containing protein  37.29 
 
 
64 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>