51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3924 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3924  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 152 aa  305  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4424  excisionase/Xis, DNA-binding  58.67 
 
 		 152 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.412812  normal  0.513103 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7903  DNA binding domain protein, excisionase family  60 
 
 		 151 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0338  DNA binding domain-containing protein  61.87 
 
 		 153 aa  173  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3279  DNA binding domain-containing protein  45.11 
 
 		 149 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.746198  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2639  hypothetical protein  42.11 
 
 		 153 aa  107  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690971  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0234  DNA binding domain protein, excisionase family  39.01 
 
 		 154 aa  99.4  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.844329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1614  excisionase domain protein  39.01 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177236  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4367  DNA binding domain-containing protein  38.3 
 
 		 155 aa  93.6  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.264021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3385  DNA binding domain-containing protein  44.09 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4151  excisionase domain-containing protein  41.94 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4630  DNA binding domain-containing protein  45 
 
 		 109 aa  90.9  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3239  putative excisionase protein  36.17 
 
 		 153 aa  90.5  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0263514 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1776  excisionase/Xis, DNA-binding  46.99 
 
 		 97 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.666085  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4162  DNA binding domain-containing protein  44.58 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0766794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0695  DNA binding domain-containing protein  39.1 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0623453  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3464  DNA binding domain protein, excisionase family  49.4 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3752  DNA binding domain protein, excisionase family  36.8 
 
 		 153 aa  84  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1265  DNA binding domain-containing protein  36.62 
 
 		 156 aa  83.6  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2344  excisionase/Xis, DNA-binding  36.62 
 
 		 156 aa  83.6  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000412399  unclonable  0.000000144936 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3978  DNA binding domain-containing protein  34.75 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.382776 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20770  DNA-binding protein, excisionase family  35.05 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4435  DNA binding domain-containing protein  32.14 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.901637  normal  0.560095 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  41.98 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0047  DNA binding domain, excisionase family  46.88 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509276  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13782  excisionase  40.48 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.696326 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1635  DNA binding domain protein, excisionase family  34.21 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04840  DNA-binding protein, excisionase family  33.03 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4763  excisionase/Xis, DNA-binding  32.61 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4008  DNA binding domain-containing protein  35.96 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03470  DNA-binding protein, excisionase family  39.02 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2993  DNA binding domain protein, excisionase family  43.75 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12334  excisionase  42.86 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3978  DNA binding domain-containing protein  38.37 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0072  DNA binding domain protein, excisionase family  39.53 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1856  excisionase/Xis, DNA-binding  30 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3800  DNA binding domain protein, excisionase family  36.14 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2889  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  35.23 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3272  DNA binding domain protein, excisionase family  44.93 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8221  DNA binding domain-containing protein  30.86 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1601  DNA binding domain protein, excisionase family  45.65 
 
 		 128 aa  50.4  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1445  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 203 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0793  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 178 aa  48.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5538  DNA binding domain-containing protein  41.3 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1031  excisionase/Xis, DNA-binding  41.3 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.126715 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3678  excision promoter, Xis  32.31 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1587  DNA binding domain-containing protein  32.81 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01190  DNA-binding protein, excisionase family  35.19 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0848  DNA binding domain protein, excisionase family  37.74 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6306  DNA binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 64 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1557  molybdate-binding protein  33.33 
 
 		 317 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>