52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2639 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2639  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  310  4.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690971  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1614  excisionase domain protein  76.47 
 
 		 154 aa  239  7.999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177236  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0234  DNA binding domain protein, excisionase family  76.47 
 
 		 154 aa  239  9e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.844329  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3239  putative excisionase protein  64.71 
 
 		 153 aa  209  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0263514 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4162  DNA binding domain-containing protein  54.55 
 
 		 155 aa  171  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0766794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1265  DNA binding domain-containing protein  52.41 
 
 		 156 aa  158  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2344  excisionase/Xis, DNA-binding  52.41 
 
 		 156 aa  158  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000412399  unclonable  0.000000144936 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4367  DNA binding domain-containing protein  51.39 
 
 		 155 aa  157  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.264021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4435  DNA binding domain-containing protein  48.28 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.901637  normal  0.560095 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3385  DNA binding domain-containing protein  50.69 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3752  DNA binding domain protein, excisionase family  48.95 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3464  DNA binding domain protein, excisionase family  49.01 
 
 		 157 aa  145  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4151  excisionase domain-containing protein  53.47 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3978  DNA binding domain-containing protein  47.22 
 
 		 150 aa  140  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.382776 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0695  DNA binding domain-containing protein  46.53 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0623453  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1776  excisionase/Xis, DNA-binding  51.04 
 
 		 97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.666085  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4630  DNA binding domain-containing protein  52.43 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3279  DNA binding domain-containing protein  41.43 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.746198  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3924  DNA binding domain-containing protein  42.11 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  43.97 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0338  DNA binding domain-containing protein  38.85 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4424  excisionase/Xis, DNA-binding  38.78 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.412812  normal  0.513103 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7903  DNA binding domain protein, excisionase family  48.19 
 
 		 151 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20770  DNA-binding protein, excisionase family  42.72 
 
 		 170 aa  90.5  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13782  excisionase  45 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.696326 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1635  DNA binding domain protein, excisionase family  40.68 
 
 		 184 aa  87.8  4e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0047  DNA binding domain, excisionase family  52.44 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509276  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04840  DNA-binding protein, excisionase family  40.4 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1856  excisionase/Xis, DNA-binding  39.22 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4763  excisionase/Xis, DNA-binding  30.63 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03470  DNA-binding protein, excisionase family  40.4 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3978  DNA binding domain-containing protein  31.53 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2993  DNA binding domain protein, excisionase family  38.82 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3272  DNA binding domain protein, excisionase family  38.6 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1445  DNA binding domain protein, excisionase family  35.58 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8221  DNA binding domain-containing protein  37.8 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12334  excisionase  41.77 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0072  DNA binding domain protein, excisionase family  36 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2889  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  35.63 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3800  DNA binding domain protein, excisionase family  31.76 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0793  DNA binding domain protein, excisionase family  40.48 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4008  DNA binding domain-containing protein  32 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1962  hypothetical protein  60 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0383954 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0848  DNA binding domain protein, excisionase family  36.99 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1587  DNA binding domain-containing protein  36.51 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0804  regulatory protein MerR  31.63 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5538  DNA binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01190  DNA-binding protein, excisionase family  47.62 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1031  excisionase/Xis, DNA-binding  40.82 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.126715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6306  DNA binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1557  molybdate-binding protein  31.25 
 
 		 317 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0405  excisionase/Xis, DNA-binding  40.82 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.831547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>