45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04840 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_04840  DNA-binding protein, excisionase family  100 
 
 		 157 aa  313  5e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1635  DNA binding domain protein, excisionase family  50.41 
 
 		 184 aa  121  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1856  excisionase/Xis, DNA-binding  47.22 
 
 		 174 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20770  DNA-binding protein, excisionase family  51.24 
 
 		 170 aa  116  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13782  excisionase  51.35 
 
 		 130 aa  107  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.696326 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03470  DNA-binding protein, excisionase family  45.54 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3239  putative excisionase protein  42.62 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0263514 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2993  DNA binding domain protein, excisionase family  41.61 
 
 		 180 aa  90.5  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3752  DNA binding domain protein, excisionase family  41.51 
 
 		 153 aa  87.4  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0047  DNA binding domain, excisionase family  53.09 
 
 		 136 aa  87  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509276  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3385  DNA binding domain-containing protein  38.53 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2639  hypothetical protein  40.4 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690971  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0695  DNA binding domain-containing protein  38.33 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0623453  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1614  excisionase domain protein  39.5 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177236  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0234  DNA binding domain protein, excisionase family  39.5 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.844329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1445  DNA binding domain protein, excisionase family  43.62 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2889  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  41.11 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3464  DNA binding domain protein, excisionase family  36.89 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3279  DNA binding domain-containing protein  39.29 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.746198  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4162  DNA binding domain-containing protein  37.04 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0766794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4630  DNA binding domain-containing protein  40 
 
 		 109 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4151  excisionase domain-containing protein  42.72 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1265  DNA binding domain-containing protein  39.22 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2344  excisionase/Xis, DNA-binding  39.22 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000412399  unclonable  0.000000144936 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3978  DNA binding domain-containing protein  37.38 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.382776 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12334  excisionase  45.24 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4367  DNA binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.264021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  44.21 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4435  DNA binding domain-containing protein  30.51 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.901637  normal  0.560095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4424  excisionase/Xis, DNA-binding  33.83 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.412812  normal  0.513103 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3924  DNA binding domain-containing protein  33.03 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8221  DNA binding domain-containing protein  40.7 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0338  DNA binding domain-containing protein  40 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7903  DNA binding domain protein, excisionase family  35.29 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4763  excisionase/Xis, DNA-binding  37.63 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1776  excisionase/Xis, DNA-binding  38.89 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.666085  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4008  DNA binding domain-containing protein  35.87 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3800  DNA binding domain protein, excisionase family  38.37 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0072  DNA binding domain protein, excisionase family  40.28 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3272  DNA binding domain protein, excisionase family  35.37 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3978  DNA binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1587  DNA binding domain-containing protein  33.87 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0793  DNA binding domain protein, excisionase family  45.16 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2742  DNA binding domain protein, excisionase family  36.76 
 
 		 113 aa  41.2  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.304559  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2706  DNA binding domain-containing protein  34.85 
 
 		 190 aa  40.4  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.781066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>