53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12334 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12334  excisionase  100 
 
 		 114 aa  222  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03470  DNA-binding protein, excisionase family  67.59 
 
 		 178 aa  130  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2993  DNA binding domain protein, excisionase family  65.38 
 
 		 180 aa  99.4  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20770  DNA-binding protein, excisionase family  44.34 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04840  DNA-binding protein, excisionase family  45.24 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1635  DNA binding domain protein, excisionase family  41.96 
 
 		 184 aa  72  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0047  DNA binding domain, excisionase family  53.95 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509276  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2889  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  42.16 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1856  excisionase/Xis, DNA-binding  46.02 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13782  excisionase  42.68 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.696326 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1614  excisionase domain protein  48.68 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177236  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0234  DNA binding domain protein, excisionase family  48.68 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.844329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4424  excisionase/Xis, DNA-binding  43.75 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.412812  normal  0.513103 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1265  DNA binding domain-containing protein  45 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2344  excisionase/Xis, DNA-binding  45 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000412399  unclonable  0.000000144936 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3279  DNA binding domain-containing protein  43.21 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.746198  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3385  DNA binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0695  DNA binding domain-containing protein  40 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0623453  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3978  DNA binding domain-containing protein  37.93 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.382776 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3924  DNA binding domain-containing protein  41.25 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4367  DNA binding domain-containing protein  41.03 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.264021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2639  hypothetical protein  41.77 
 
 		 153 aa  62  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690971  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4162  DNA binding domain-containing protein  40.26 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0766794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3464  DNA binding domain protein, excisionase family  35 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3239  putative excisionase protein  37.35 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0263514 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2742  DNA binding domain protein, excisionase family  38.96 
 
 		 113 aa  58.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.304559  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0338  DNA binding domain-containing protein  45.9 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4435  DNA binding domain-containing protein  37.88 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.901637  normal  0.560095 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4630  DNA binding domain-containing protein  38.16 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1445  DNA binding domain protein, excisionase family  40.43 
 
 		 203 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7903  DNA binding domain protein, excisionase family  35.21 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3752  DNA binding domain protein, excisionase family  33.75 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1776  excisionase/Xis, DNA-binding  38.03 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.666085  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4151  excisionase domain-containing protein  36.76 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  41.54 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1587  DNA binding domain-containing protein  42.42 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0072  DNA binding domain protein, excisionase family  42.62 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8221  DNA binding domain-containing protein  46.03 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0848  DNA binding domain protein, excisionase family  48.15 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3272  DNA binding domain protein, excisionase family  45.65 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4763  excisionase/Xis, DNA-binding  30.88 
 
 		 158 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3779  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  50.98 
 
 		 232 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00106137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1158  DNA binding domain protein, excisionase family  39.62 
 
 		 320 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000597249  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01890  DNA-binding protein, excisionase family  43.1 
 
 		 321 aa  44.3  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0766202 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1557  molybdate-binding protein  41.82 
 
 		 317 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3978  DNA binding domain-containing protein  42.55 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0405  excisionase/Xis, DNA-binding  48.94 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.831547 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3653  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  43.55 
 
 		 231 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.981965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3794  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  43.55 
 
 		 231 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0123401  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3800  DNA binding domain protein, excisionase family  31.25 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3711  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  43.55 
 
 		 231 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.515832  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0019  DNA binding domain protein, excisionase family  31.88 
 
 		 326 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  46.67 
 
 		 206 aa  40.4  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>