43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_4435 on replicon NC_009036
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009036  Sbal_4435  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 
149 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.901637  normal  0.560095 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3978  DNA binding domain-containing protein  58.33 
 
 
150 aa  181  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.382776 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2639  hypothetical protein  48.28 
 
 
153 aa  155  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690971  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1614  excisionase domain protein  46.21 
 
 
154 aa  152  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177236  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0234  DNA binding domain protein, excisionase family  46.21 
 
 
154 aa  152  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.844329  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2344  excisionase/Xis, DNA-binding  42.07 
 
 
156 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000412399  unclonable  0.000000144936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1265  DNA binding domain-containing protein  42.07 
 
 
156 aa  136  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4367  DNA binding domain-containing protein  39.58 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.264021  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4162  DNA binding domain-containing protein  39.04 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0766794  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0695  DNA binding domain-containing protein  37.58 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0623453  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3385  DNA binding domain-containing protein  39.19 
 
 
150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3239  putative excisionase protein  35.95 
 
 
153 aa  123  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0263514 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4151  excisionase domain-containing protein  40.38 
 
 
157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3752  DNA binding domain protein, excisionase family  37.76 
 
 
153 aa  115  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3464  DNA binding domain protein, excisionase family  36.84 
 
 
157 aa  110  8.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1776  excisionase/Xis, DNA-binding  39.58 
 
 
97 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.666085  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  38.3 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3279  DNA binding domain-containing protein  32.86 
 
 
149 aa  90.1  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.746198  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13782  excisionase  39.45 
 
 
130 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.696326 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4424  excisionase/Xis, DNA-binding  31.36 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.412812  normal  0.513103 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0338  DNA binding domain-containing protein  34.71 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7903  DNA binding domain protein, excisionase family  35.14 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3924  DNA binding domain-containing protein  32.14 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4630  DNA binding domain-containing protein  36.89 
 
 
109 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03470  DNA-binding protein, excisionase family  35.24 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04840  DNA-binding protein, excisionase family  30.51 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287147  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2993  DNA binding domain protein, excisionase family  33.71 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1635  DNA binding domain protein, excisionase family  28.57 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20770  DNA-binding protein, excisionase family  28.57 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4763  excisionase/Xis, DNA-binding  30.53 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0047  DNA binding domain, excisionase family  35 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509276  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1856  excisionase/Xis, DNA-binding  34.15 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3978  DNA binding domain-containing protein  27.13 
 
 
158 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12334  excisionase  37.88 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2889  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  34.78 
 
 
167 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1445  DNA binding domain protein, excisionase family  27.73 
 
 
203 aa  53.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8221  DNA binding domain-containing protein  26.88 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0072  DNA binding domain protein, excisionase family  26.67 
 
 
141 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4008  DNA binding domain-containing protein  25.77 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0848  DNA binding domain protein, excisionase family  35.62 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1587  DNA binding domain-containing protein  36.23 
 
 
166 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3800  DNA binding domain protein, excisionase family  26.51 
 
 
171 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2742  DNA binding domain protein, excisionase family  29.76 
 
 
113 aa  40.4  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.304559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>