43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0338 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0338  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 
153 aa  303  6e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4424  excisionase/Xis, DNA-binding  75.32 
 
 
152 aa  223  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.412812  normal  0.513103 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7903  DNA binding domain protein, excisionase family  67.32 
 
 
151 aa  190  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3924  DNA binding domain-containing protein  60.13 
 
 
152 aa  183  9e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3279  DNA binding domain-containing protein  48.34 
 
 
149 aa  124  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.746198  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2639  hypothetical protein  40.52 
 
 
153 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690971  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1614  excisionase domain protein  42.54 
 
 
154 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177236  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0234  DNA binding domain protein, excisionase family  42.54 
 
 
154 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.844329  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2344  excisionase/Xis, DNA-binding  40 
 
 
156 aa  94  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000412399  unclonable  0.000000144936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1265  DNA binding domain-containing protein  40 
 
 
156 aa  94  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3752  DNA binding domain protein, excisionase family  41.43 
 
 
153 aa  94  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4151  excisionase domain-containing protein  40.44 
 
 
157 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3385  DNA binding domain-containing protein  46.94 
 
 
150 aa  91.3  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3464  DNA binding domain protein, excisionase family  42.75 
 
 
157 aa  90.9  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4435  DNA binding domain-containing protein  35.46 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.901637  normal  0.560095 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3978  DNA binding domain-containing protein  38.57 
 
 
150 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.382776 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0695  DNA binding domain-containing protein  43.17 
 
 
153 aa  87.4  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0623453  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4367  DNA binding domain-containing protein  38.06 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.264021  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3239  putative excisionase protein  38.81 
 
 
153 aa  84.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0263514 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4162  DNA binding domain-containing protein  38.57 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0766794  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4630  DNA binding domain-containing protein  49.4 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  41.61 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1776  excisionase/Xis, DNA-binding  43.96 
 
 
97 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.666085  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20770  DNA-binding protein, excisionase family  41.24 
 
 
170 aa  75.1  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1635  DNA binding domain protein, excisionase family  40.4 
 
 
184 aa  73.6  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13782  excisionase  45.78 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.696326 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04840  DNA-binding protein, excisionase family  39.78 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287147  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4763  excisionase/Xis, DNA-binding  36.08 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2993  DNA binding domain protein, excisionase family  35.07 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3978  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 
158 aa  61.6  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03470  DNA-binding protein, excisionase family  40.66 
 
 
178 aa  61.6  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12334  excisionase  43.84 
 
 
114 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4008  DNA binding domain-containing protein  35.96 
 
 
132 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0047  DNA binding domain, excisionase family  47.46 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509276  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3800  DNA binding domain protein, excisionase family  37.93 
 
 
171 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2889  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  30.43 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0072  DNA binding domain protein, excisionase family  37.78 
 
 
141 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1587  DNA binding domain-containing protein  33 
 
 
166 aa  51.6  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8221  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1856  excisionase/Xis, DNA-binding  35.44 
 
 
174 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1445  DNA binding domain protein, excisionase family  40.28 
 
 
203 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1601  DNA binding domain protein, excisionase family  36.21 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10758  transcriptional regulator  45 
 
 
168 aa  41.2  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.03304e-31  normal  0.354677 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>