42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2889 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2889  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  100 
 
 		 167 aa  332  2e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03470  DNA-binding protein, excisionase family  46.21 
 
 		 178 aa  117  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2993  DNA binding domain protein, excisionase family  38.52 
 
 		 180 aa  94.4  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20770  DNA-binding protein, excisionase family  41.49 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04840  DNA-binding protein, excisionase family  41.11 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0047  DNA binding domain, excisionase family  44.87 
 
 		 136 aa  70.5  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509276  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3385  DNA binding domain-containing protein  37.86 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1856  excisionase/Xis, DNA-binding  32.28 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1445  DNA binding domain protein, excisionase family  46.15 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13782  excisionase  39.36 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.696326 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12334  excisionase  46.67 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3978  DNA binding domain-containing protein  31.97 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.382776 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2639  hypothetical protein  35.63 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690971  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0695  DNA binding domain-containing protein  34.18 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0623453  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4424  excisionase/Xis, DNA-binding  32.77 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.412812  normal  0.513103 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3924  DNA binding domain-containing protein  35.23 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0234  DNA binding domain protein, excisionase family  39.24 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.844329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1614  excisionase domain protein  39.24 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177236  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3239  putative excisionase protein  36.71 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0263514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0072  DNA binding domain protein, excisionase family  41.43 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4162  DNA binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0766794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1635  DNA binding domain protein, excisionase family  29.27 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4630  DNA binding domain-containing protein  36.71 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3752  DNA binding domain protein, excisionase family  37.08 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4435  DNA binding domain-containing protein  34.78 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.901637  normal  0.560095 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2344  excisionase/Xis, DNA-binding  36.47 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000412399  unclonable  0.000000144936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1265  DNA binding domain-containing protein  36.47 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3464  DNA binding domain protein, excisionase family  32.18 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3279  DNA binding domain-containing protein  29.27 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.746198  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3272  DNA binding domain protein, excisionase family  35.24 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4367  DNA binding domain-containing protein  34.15 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.264021  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4151  excisionase domain-containing protein  29.09 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0338  DNA binding domain-containing protein  34.88 
 
 		 153 aa  50.8  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0804  regulatory protein MerR  36.17 
 
 		 132 aa  50.8  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7903  DNA binding domain protein, excisionase family  36.05 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  28.43 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1776  excisionase/Xis, DNA-binding  33.33 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.666085  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8221  DNA binding domain-containing protein  31.25 
 
 		 149 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3800  DNA binding domain protein, excisionase family  24.32 
 
 		 171 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4008  DNA binding domain-containing protein  27.63 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0848  DNA binding domain protein, excisionase family  44 
 
 		 127 aa  41.2  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2298  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.42 
 
 		 413 aa  40.8  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266378  normal  0.174945 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>