86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6306 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6306  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 64 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5538  DNA binding domain-containing protein  93.75 
 
 		 64 aa  118  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1031  excisionase/Xis, DNA-binding  92.19 
 
 		 64 aa  117  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.126715 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0405  excisionase/Xis, DNA-binding  75 
 
 		 63 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.831547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5521  DNA binding domain-containing protein  63.08 
 
 		 65 aa  77  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00471418  normal  0.965318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5325  DNA binding domain-containing protein  64.06 
 
 		 61 aa  77  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0330031 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0643  DNA binding domain protein, excisionase family  53.33 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1536  DNA binding domain-containing protein  48.15 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  42.37 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0475  DNA binding domain protein, excisionase family  51.16 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4561  DNA binding domain protein, excisionase family  36.21 
 
 		 335 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000373649  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  40.68 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2977  DNA binding domain protein, excisionase family  43.86 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.467459  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1923  phage transcriptional regulator, AlpA  47.17 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.151509  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4151  excisionase domain-containing protein  44.44 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  42.55 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1557  molybdate-binding protein  41.67 
 
 		 317 aa  47.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4535  DNA binding domain protein, excisionase family  44.44 
 
 		 61 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5098  periplasmic molybdate-binding protein  38.78 
 
 		 306 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  46.15 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0663  DNA binding domain-containing protein  48.84 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.292535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0262  hypothetical protein  45.28 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  51.28 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  38.78 
 
 		 306 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  38.78 
 
 		 315 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  38.78 
 
 		 315 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  36.73 
 
 		 306 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  36.73 
 
 		 306 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  36.73 
 
 		 306 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  36.73 
 
 		 315 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  42.55 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  45 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  37.5 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0047  DNA binding domain, excisionase family  45.1 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509276  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  39.53 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  36.73 
 
 		 306 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5764  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  46.15 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  43.59 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  43.59 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01190  DNA-binding protein, excisionase family  44.68 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0187  DNA binding domain-containing protein  36.73 
 
 		 306 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  33.93 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  43.59 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2993  DNA binding domain protein, excisionase family  44.23 
 
 		 180 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  43.59 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 		 308 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0201  DNA binding domain-containing protein  36.73 
 
 		 305 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0830  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0061  DNA binding domain protein, excisionase family  45.1 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2639  hypothetical protein  40.82 
 
 		 153 aa  43.5  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690971  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1174  phage transcriptional regulator, AlpA  39.22 
 
 		 65 aa  43.5  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1996  hypothetical protein  42.31 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.327621 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3239  putative excisionase protein  37.5 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0263514 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2623  prophage LambdaBa02, DNA-binding protein, putative  28.85 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00448007  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10510  hypothetical protein  45 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0288  excisionase, putative  37.29 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0413  DNA binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3279  DNA binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.746198  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1737  DNA binding domain protein, excisionase family  38 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  39.53 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0173  DNA binding domain protein, excisionase family  52.5 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3924  DNA binding domain-containing protein  39.13 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5007  DNA binding domain protein, excisionase family  41.03 
 
 		 67 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0520811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  42.86 
 
 		 206 aa  41.6  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4162  DNA binding domain-containing protein  38.98 
 
 		 155 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0766794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1829  DNA binding domain-containing protein  44.68 
 
 		 109 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0662  DNA binding domain-containing protein  44.74 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.87984 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  44.74 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0183  excisionase/Xis, DNA-binding  40.43 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.50459 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0669  excisionase/Xis, DNA-binding protein  44.74 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.873991  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20770  DNA-binding protein, excisionase family  43.86 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0682  DNA binding domain-containing protein  44.74 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160899  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  44.74 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0838  DNA binding domain-containing protein  44.74 
 
 		 90 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.385284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0074  DNA binding domain-containing protein  44.74 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7903  DNA binding domain protein, excisionase family  36.73 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0403  DNA binding domain-containing protein  43.4 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00109148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0019  DNA binding domain protein, excisionase family  38.1 
 
 		 326 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1635  DNA binding domain protein, excisionase family  46 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0848  DNA binding domain protein, excisionase family  38.98 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2760  putative transcriptional regulator  34.38 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466966 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1601  DNA binding domain protein, excisionase family  41.67 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0343  DNA binding domain-containing protein  33.93 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3757  excisionase/Xis, DNA-binding  38.46 
 
 		 58 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2965  hypothetical protein  39.62 
 
 		 89 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.742422  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2921  hypothetical protein  39.62 
 
 		 89 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>