21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2059 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2059  excisionase/Xis, DNA-binding  100 
 
 		 105 aa  207  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0748  excisionase/Xis, DNA-binding  73.17 
 
 		 104 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.613095 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1790  DNA binding domain-containing protein  43.33 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0933  DNA binding domain protein  38.6 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5764  DNA binding domain-containing protein, excisionase family  36.54 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4273  DNA binding domain protein, excisionase family  36.67 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1508  DNA binding domain-containing protein  36.17 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000123588 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2684  excisionase/Xis, DNA-binding  37.88 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01190  DNA-binding protein, excisionase family  40 
 
 		 164 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  32.14 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  33.33 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0343  DNA binding domain-containing protein  29.82 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4091  DNA binding domain protein, excisionase family  38.3 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3029  DNA binding domain protein, excisionase family  40.82 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.029266 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0343  DNA binding domain protein, excisionase family  31.58 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1737  DNA binding domain protein, excisionase family  34.62 
 
 		 315 aa  40.4  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1168  hypothetical protein  34.72 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0277  DNA binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.830937  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1213  DNA binding domain-containing protein  37.29 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134195  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4589  DNA binding domain protein, excisionase family  32.69 
 
 		 112 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>