27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3029 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3029  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 137 aa  272  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.029266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3544  phage excisionase  50 
 
 		 149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4091  DNA binding domain protein, excisionase family  45.99 
 
 		 151 aa  123  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1508  DNA binding domain-containing protein  47.48 
 
 		 140 aa  123  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000123588 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1809  excisionase/Xis, DNA-binding  38.93 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2421  DNA binding domain-containing protein  38.93 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00439934  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2425  DNA binding domain-containing protein  38.93 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5748  excisionase/Xis, DNA-binding  38.93 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1790  DNA binding domain-containing protein  30.07 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1346  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000136372  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2684  excisionase/Xis, DNA-binding  40 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0720  DNA binding domain-containing protein  50 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.60238  normal  0.0504983 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0363  hypothetical protein  22.14 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  40.58 
 
 		 206 aa  47  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1370  DNA binding domain protein, excisionase family  38 
 
 		 94 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2049  DNA binding domain-containing protein  40 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.531029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0399  DNA binding domain protein  42.22 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2944  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  6.70203e-60  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2677  DNA binding domain protein, excisionase family  36.36 
 
 		 248 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000367572  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1311  regulatory protein, MerR  38.78 
 
 		 67 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.518495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0700  DNA binding domain-containing protein  25.76 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000271881  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2507  DNA binding domain protein, excisionase family  38 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.286901  normal  0.381075 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3794  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  36.84 
 
 		 231 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0123401  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2059  excisionase/Xis, DNA-binding  40.82 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3711  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  36.84 
 
 		 231 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.515832  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3757  excisionase/Xis, DNA-binding  28.85 
 
 		 58 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5834  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 		 78 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.577316 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>