19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0363 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0363  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  293  4e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1346  MerR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 156 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000136372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1508  DNA binding domain-containing protein  41.82 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000123588 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1790  DNA binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4091  DNA binding domain protein, excisionase family  43.75 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  32.93 
 
 		 206 aa  50.1  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3544  phage excisionase  41.3 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3029  DNA binding domain protein, excisionase family  22.14 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.029266 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2133  DNA binding domain-containing protein  40.82 
 
 		 252 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1738  DNA binding domain-containing protein  42.55 
 
 		 272 aa  47  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0700  DNA binding domain-containing protein  34.09 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000271881  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2507  DNA binding domain protein, excisionase family  32.39 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.286901  normal  0.381075 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3757  excisionase/Xis, DNA-binding  31.37 
 
 		 58 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01114  hypothetical protein  33.96 
 
 		 56 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0783  DNA binding domain protein, excisionase family  33.33 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  38.3 
 
 		 57 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1829  DNA binding domain-containing protein  35.38 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2614  phage transcriptional regulator, AlpA  30.16 
 
 		 75 aa  40.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.317776 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0057  DNA binding domain protein, excisionase family  32.88 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>