26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1829 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1829  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 
109 aa  212  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  43.55 
 
 
206 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1809  excisionase/Xis, DNA-binding  50 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2421  DNA binding domain-containing protein  50 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00439934  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2425  DNA binding domain-containing protein  47.62 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0700  DNA binding domain-containing protein  28.38 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000271881  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2677  DNA binding domain protein, excisionase family  43.75 
 
 
248 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000367572  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5748  excisionase/Xis, DNA-binding  47.62 
 
 
165 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0250382  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0343  DNA binding domain protein, excisionase family  42.59 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  33.33 
 
 
315 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  33.33 
 
 
315 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2705  DNA binding domain protein, excisionase family  35.59 
 
 
75 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  33.33 
 
 
315 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6306  DNA binding domain-containing protein  44.68 
 
 
64 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5538  DNA binding domain-containing protein  44.68 
 
 
64 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1031  excisionase/Xis, DNA-binding  44.68 
 
 
64 aa  41.6  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.126715 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  35.29 
 
 
306 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  35.29 
 
 
306 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  35.29 
 
 
306 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0363  hypothetical protein  35.38 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3757  excisionase/Xis, DNA-binding  38.3 
 
 
58 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0759  Prophage CP4-57 regulatory  40 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  35.29 
 
 
306 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3544  phage excisionase  40.48 
 
 
149 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374064  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2459  hypothetical protein  57.58 
 
 
86 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000203148  unclonable  0.00000000025988 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1557  molybdate-binding protein  32.61 
 
 
317 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>