30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1809 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1809  excisionase/Xis, DNA-binding  100 
 
 		 137 aa  271  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202545  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2421  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 137 aa  271  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00439934  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2425  DNA binding domain-containing protein  99.27 
 
 		 137 aa  269  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329887 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5748  excisionase/Xis, DNA-binding  86.13 
 
 		 165 aa  240  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3029  DNA binding domain protein, excisionase family  38.93 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.029266 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4091  DNA binding domain protein, excisionase family  33.83 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1508  DNA binding domain-containing protein  31.16 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000123588 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1790  DNA binding domain-containing protein  20.95 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3544  phage excisionase  34.56 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1829  DNA binding domain-containing protein  50 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2684  excisionase/Xis, DNA-binding  52.27 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0399  DNA binding domain protein  46.81 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1370  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2049  DNA binding domain-containing protein  50 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.531029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0277  DNA binding domain-containing protein  52.17 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.830937  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3757  excisionase/Xis, DNA-binding  45.45 
 
 		 58 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0230  DNA binding domain-containing protein  46.81 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.016519 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0700  DNA binding domain-containing protein  38.64 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000271881  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5108  hypothetical protein  40.43 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3605  hypothetical protein  40.43 
 
 		 88 aa  42  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413146  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1346  MerR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 156 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000136372  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  41.67 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  41.38 
 
 		 206 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0403  DNA binding domain-containing protein  43.59 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00109148  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2705  DNA binding domain protein, excisionase family  46.67 
 
 		 75 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  42.55 
 
 		 315 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  42.55 
 
 		 306 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  42.55 
 
 		 306 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  42.55 
 
 		 306 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>