95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_2158 on replicon NC_013386
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 		 206 aa  413  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4994  MerR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3132  MerR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162132 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14950  hypothetical protein  30.43 
 
 		 183 aa  62  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0300197  normal  0.637902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3399  MerR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.72051 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3093  putative transcriptional regulator, MerR family  26.57 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041741  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5353  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102121  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2885  MerR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2872  MerR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2841  MerR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1545  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467774 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11860  hypothetical protein  30.69 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2772  regulatory protein MerR  31.68 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576027  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1544  MerR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.046414  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1471  MerR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.151403 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1741  transcriptional regulator, MerR family  30.48 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22550  hypothetical protein  30.69 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2099  transcriptional regulator, MerR family  29.52 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4007  transcriptional regulator, MerR family  29.7 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.342796  normal  0.0575255 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1223  MerR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.112022  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1883  transcriptional regulator, MerR family  29.17 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0324581 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2336  transcriptional regulator, MerR family  30.69 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13820  hypothetical protein  28.57 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1696  MerR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.057009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2723  transcriptional regulator, MerR family  29.7 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18280  hypothetical protein  28.57 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.40655 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1300  transcriptional regulator, MerR family  28.32 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.850599  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2379  regulatory protein, MerR  27.74 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0361143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15540  hypothetical protein  25.74 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4005  putative transcriptional regulator, MerR family  28.03 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2517  MerR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620337  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3131  transcriptional regulator, MerR family  27.97 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2710  regulatory protein, MerR  28.57 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733611  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  40 
 
 		 315 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  38.33 
 
 		 306 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  38.33 
 
 		 306 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  38.33 
 
 		 306 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2431  transcriptional regulator, MerR family  26.35 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000161855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  38.33 
 
 		 315 aa  51.6  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3740  transcriptional regulator, MerR family  28.24 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.241399 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0201  DNA binding domain-containing protein  44.23 
 
 		 305 aa  50.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1829  DNA binding domain-containing protein  43.55 
 
 		 109 aa  50.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0363  hypothetical protein  32.93 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0797  hypothetical protein  23.45 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  36.67 
 
 		 306 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  38.33 
 
 		 306 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0187  DNA binding domain-containing protein  43.4 
 
 		 306 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  38.33 
 
 		 315 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5098  periplasmic molybdate-binding protein  36.67 
 
 		 306 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0472  SoxR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1472  transcriptional regulator, MerR family  28.21 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2780  phage transcriptional regulator, AlpA  46.15 
 
 		 57 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0923797  normal  0.386289 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3029  DNA binding domain protein, excisionase family  40.58 
 
 		 137 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.029266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3544  phage excisionase  33.73 
 
 		 149 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1397  regulatory protein, MerR  28.68 
 
 		 264 aa  46.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115331  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4561  DNA binding domain protein, excisionase family  38.03 
 
 		 335 aa  46.6  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000373649  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1790  DNA binding domain-containing protein  40.38 
 
 		 155 aa  46.2  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0047  DNA binding domain, excisionase family  46.55 
 
 		 136 aa  45.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509276  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01114  hypothetical protein  45.83 
 
 		 56 aa  45.1  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1031  excisionase/Xis, DNA-binding  44.07 
 
 		 64 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.126715 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0957  excision promoter, Xis  40 
 
 		 69 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.392434  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0343  DNA binding domain protein, excisionase family  39.22 
 
 		 66 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4353  putative transcriptional regulator  37.31 
 
 		 74 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1557  molybdate-binding protein  36.96 
 
 		 317 aa  43.5  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0399  DNA binding domain protein  41.82 
 
 		 70 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5538  DNA binding domain-containing protein  44.9 
 
 		 64 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0271  excisionase/Xis, DNA-binding  42 
 
 		 139 aa  43.5  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000397414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1079  DNA-binding protein/PTS system, IIA component  43.24 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0403  DNA binding domain-containing protein  39.06 
 
 		 118 aa  43.5  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00109148  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  30.36 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  30.36 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  30.36 
 
 		 180 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0156  DNA binding domain-containing protein  34.43 
 
 		 70 aa  42.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000704193 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0230  DNA binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 59 aa  42.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.016519 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2705  DNA binding domain protein, excisionase family  44.9 
 
 		 75 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3263  excision promoter, Xis  35.94 
 
 		 75 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0057  DNA binding domain protein, excisionase family  50 
 
 		 126 aa  42.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 371 aa  42.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2677  DNA binding domain protein, excisionase family  39.58 
 
 		 248 aa  42.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000367572  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1737  DNA binding domain protein, excisionase family  38.78 
 
 		 315 aa  42.4  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0933  DNA binding domain protein  41.94 
 
 		 73 aa  42  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  38.46 
 
 		 78 aa  42  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5607  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 333 aa  42  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0019  DNA binding domain protein, excisionase family  40 
 
 		 326 aa  42  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6306  DNA binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 64 aa  41.6  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5748  excisionase/Xis, DNA-binding  30 
 
 		 165 aa  41.6  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0812  DNA binding domain protein, excisionase family  28.69 
 
 		 308 aa  41.6  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1809  excisionase/Xis, DNA-binding  41.38 
 
 		 137 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202545  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2350  DNA binding domain protein, excisionase family  44.44 
 
 		 66 aa  41.6  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.110873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2421  DNA binding domain-containing protein  41.38 
 
 		 137 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00439934  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3553  phage transcriptional regulator, AlpA  35.48 
 
 		 126 aa  41.2  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12334  excisionase  46.67 
 
 		 114 aa  41.2  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2133  DNA binding domain-containing protein  35.59 
 
 		 252 aa  41.2  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2425  DNA binding domain-containing protein  41.38 
 
 		 137 aa  41.2  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>