51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3131 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3131  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 218 aa  431  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2099  transcriptional regulator, MerR family  68.89 
 
 		 193 aa  226  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1883  transcriptional regulator, MerR family  66.67 
 
 		 194 aa  224  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0324581 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13820  hypothetical protein  72.78 
 
 		 187 aa  223  3e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1696  MerR family transcriptional regulator  65.56 
 
 		 206 aa  221  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.057009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5353  transcriptional regulator, MerR family  60.43 
 
 		 188 aa  217  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102121  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15540  hypothetical protein  77.7 
 
 		 194 aa  216  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3399  MerR family transcriptional regulator  62.92 
 
 		 234 aa  215  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.72051 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4007  transcriptional regulator, MerR family  72.46 
 
 		 180 aa  214  8e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.342796  normal  0.0575255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4005  putative transcriptional regulator, MerR family  74.13 
 
 		 206 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1741  transcriptional regulator, MerR family  63.39 
 
 		 198 aa  213  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1544  MerR family transcriptional regulator  71.61 
 
 		 198 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.046414  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1545  transcriptional regulator, MerR family  78.36 
 
 		 197 aa  213  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467774 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2431  transcriptional regulator, MerR family  73.38 
 
 		 203 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000161855  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1223  MerR family transcriptional regulator  78.2 
 
 		 200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.112022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22550  hypothetical protein  73.91 
 
 		 189 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18280  hypothetical protein  77.44 
 
 		 243 aa  212  2.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.40655 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1300  transcriptional regulator, MerR family  72.73 
 
 		 195 aa  210  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.850599  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11860  hypothetical protein  63.74 
 
 		 225 aa  209  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2723  transcriptional regulator, MerR family  62.98 
 
 		 190 aa  209  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2885  MerR family transcriptional regulator  69.18 
 
 		 206 aa  208  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2841  MerR family transcriptional regulator  69.18 
 
 		 206 aa  208  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2872  MerR family transcriptional regulator  69.18 
 
 		 206 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2336  transcriptional regulator, MerR family  66.01 
 
 		 205 aa  208  7e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3132  MerR family transcriptional regulator  69.18 
 
 		 207 aa  207  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162132 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3093  putative transcriptional regulator, MerR family  76.3 
 
 		 199 aa  207  9e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041741  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2772  regulatory protein MerR  66.67 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576027  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14950  hypothetical protein  73.88 
 
 		 183 aa  206  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0300197  normal  0.637902 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1471  MerR family transcriptional regulator  65.33 
 
 		 204 aa  203  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.151403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4994  MerR family transcriptional regulator  63.69 
 
 		 208 aa  201  7e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2517  MerR family transcriptional regulator  63.29 
 
 		 186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620337  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2379  regulatory protein, MerR  68.15 
 
 		 188 aa  197  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0361143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1397  regulatory protein, MerR  69.12 
 
 		 264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115331  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3740  transcriptional regulator, MerR family  66.67 
 
 		 169 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.241399 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2710  regulatory protein, MerR  69.78 
 
 		 198 aa  187  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733611  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1472  transcriptional regulator, MerR family  62.07 
 
 		 197 aa  175  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0472  SoxR family transcriptional regulator  51.15 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0797  hypothetical protein  48.09 
 
 		 201 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 212 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7824  hypothetical protein  33.56 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  32.56 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2158  DNA binding domain protein, excisionase family  27.97 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1319  MerR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 174 aa  49.3  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0971  transcriptional regulator, MerR family  32.47 
 
 		 148 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.697398 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  30.95 
 
 		 143 aa  46.2  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 147 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2212  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 158 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.247421  normal  0.739678 
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 149 aa  42.7  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3123  putative transcriptional regulator, MerR family  28.21 
 
 		 152 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.907307 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23510  predicted transcriptional regulator  35.71 
 
 		 138 aa  42  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.719058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4355  hypothetical protein  32.08 
 
 		 202 aa  41.6  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259462 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>