46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7824 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7824  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  430  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4355  hypothetical protein  47.57 
 
 		 202 aa  138  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259462 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1471  MerR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.151403 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14950  hypothetical protein  37.61 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0300197  normal  0.637902 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1883  transcriptional regulator, MerR family  35.34 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0324581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4994  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1741  transcriptional regulator, MerR family  35.34 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3740  transcriptional regulator, MerR family  34.48 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.241399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1397  regulatory protein, MerR  36.61 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115331  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3131  transcriptional regulator, MerR family  33.81 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2099  transcriptional regulator, MerR family  35.34 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2517  MerR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620337  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1223  MerR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.112022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18280  hypothetical protein  35.04 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.40655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1696  MerR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.057009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1300  transcriptional regulator, MerR family  33.62 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.850599  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2336  transcriptional regulator, MerR family  32.23 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.428593  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5353  transcriptional regulator, MerR family  32.23 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0102121  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1545  transcriptional regulator, MerR family  32.76 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4007  transcriptional regulator, MerR family  32.23 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.342796  normal  0.0575255 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1544  MerR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.046414  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2379  regulatory protein, MerR  28.37 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0361143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4005  putative transcriptional regulator, MerR family  32.48 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3093  putative transcriptional regulator, MerR family  31.62 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0041741  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2723  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2772  regulatory protein MerR  32.46 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.576027  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13820  hypothetical protein  34.55 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15540  hypothetical protein  31.62 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2431  transcriptional regulator, MerR family  34.11 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000161855  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11860  hypothetical protein  28.37 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2841  MerR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2885  MerR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3132  MerR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2872  MerR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3399  MerR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.72051 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22550  hypothetical protein  30.41 
 
 		 189 aa  52  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0818404  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1472  transcriptional regulator, MerR family  29.91 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0472  SoxR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  40.48 
 
 		 377 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4520  protein of unknown function DUF433  31.51 
 
 		 97 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000972805  normal  0.975603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2710  regulatory protein, MerR  30.16 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733611  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3472  hypothetical protein  40 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.84444 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4858  hypothetical protein  38.89 
 
 		 220 aa  42  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.332293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5692  protein of unknown function DUF433  43.86 
 
 		 86 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2516  protein of unknown function DUF433  33.8 
 
 		 82 aa  42  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0559942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>