60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5692 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5692  protein of unknown function DUF433  100 
 
 
86 aa  176  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0170  protein of unknown function DUF433  46.58 
 
 
94 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0165  protein of unknown function DUF433  46.58 
 
 
95 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.313668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0655  hypothetical protein  53.03 
 
 
71 aa  78.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.418229  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2498  hypothetical protein  52.54 
 
 
72 aa  78.2  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.799873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0673  hypothetical protein  51.67 
 
 
78 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0278859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4550  protein of unknown function DUF433  43.84 
 
 
79 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.266998  normal  0.934989 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2643  hypothetical protein  36.36 
 
 
76 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1367  hypothetical protein  36.76 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.883887  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1772  hypothetical protein  34.78 
 
 
82 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.5052  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0439  hypothetical protein  36.51 
 
 
127 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4167  hypothetical protein  30.88 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338613  decreased coverage  0.00000145302 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4375  hypothetical protein  36.54 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0117722  normal  0.386132 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1799  protein of unknown function DUF433  35.38 
 
 
74 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.69777  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0712  hypothetical protein  33.33 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10879  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4961  hypothetical protein  33.87 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0169  hypothetical protein  31.34 
 
 
73 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3434  protein of unknown function DUF433  38.33 
 
 
78 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2719  hypothetical protein  39.58 
 
 
73 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.35645 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3561  protein of unknown function DUF433  33.33 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0506112 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4945  protein of unknown function DUF433  44.44 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0459524  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1741  hypothetical protein  31.82 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0110303  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5088  protein of unknown function DUF433  33.82 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000523487  normal  0.135108 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2222  hypothetical protein  29.87 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00122124  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1913  protein of unknown function DUF433  32.31 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0274585  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1888  protein of unknown function DUF433  32.31 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1327  protein of unknown function DUF433  33.9 
 
 
75 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225819  normal  0.0285515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1299  protein of unknown function DUF433  33.9 
 
 
75 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1312  hypothetical protein  29.82 
 
 
83 aa  47  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2516  protein of unknown function DUF433  29.03 
 
 
82 aa  47  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0559942  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2090  protein of unknown function DUF433  32.26 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1682  hypothetical protein  30.51 
 
 
76 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00134112  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0695  hypothetical protein  28.4 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.173069  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4858  hypothetical protein  41.67 
 
 
220 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.332293  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0280  protein of unknown function DUF433  36.17 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.850652  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1708  protein of unknown function DUF433  35 
 
 
74 aa  45.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0538  hypothetical protein  27.14 
 
 
81 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4279  protein of unknown function DUF433  24.24 
 
 
81 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2761  hypothetical protein  35.19 
 
 
73 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.315321  normal  0.254 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3160  protein of unknown function DUF433  36.21 
 
 
82 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.419433  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4513  protein of unknown function DUF433  29.41 
 
 
78 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1887  protein of unknown function DUF433  31.82 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5015  hypothetical protein  33.93 
 
 
74 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.819476  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0500  protein of unknown function DUF433  33.85 
 
 
74 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179927  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4619  protein of unknown function DUF433  26.47 
 
 
81 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2760  hypothetical protein  42.86 
 
 
74 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.986654  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4630  protein of unknown function DUF433  31.15 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.569731  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0082  hypothetical protein  33.33 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.024664 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0293  protein of unknown function DUF433  32.61 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1154  protein of unknown function DUF433  30.51 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3472  hypothetical protein  42.55 
 
 
217 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.84444 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4899  hypothetical protein  35.38 
 
 
76 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0636447  normal  0.113291 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1355  protein of unknown function DUF433  21.43 
 
 
84 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0014306  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5918  protein of unknown function DUF433  39.53 
 
 
125 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2195  hypothetical protein  30 
 
 
74 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2185  hypothetical protein  30 
 
 
74 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0533  hypothetical protein  27.94 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38685  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0057  protein of unknown function DUF433  30 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0429  protein of unknown function DUF433  34.09 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4191  hypothetical protein  32.2 
 
 
76 aa  40.4  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.145277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>