103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4191 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4191  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  157  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.145277 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1799  protein of unknown function DUF433  75.34 
 
 		 74 aa  117  7e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.69777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1888  protein of unknown function DUF433  69.86 
 
 		 74 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1913  protein of unknown function DUF433  69.86 
 
 		 74 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0274585  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1741  hypothetical protein  68.49 
 
 		 76 aa  110  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0110303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0500  protein of unknown function DUF433  68.57 
 
 		 74 aa  108  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2090  protein of unknown function DUF433  67.57 
 
 		 75 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0082  hypothetical protein  70.59 
 
 		 76 aa  104  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.024664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3434  protein of unknown function DUF433  64.86 
 
 		 78 aa  104  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0894  protein of unknown function DUF433  73.85 
 
 		 73 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5015  hypothetical protein  66.67 
 
 		 74 aa  98.2  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.819476  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0946  hypothetical protein  66.15 
 
 		 75 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3242  protein of unknown function DUF433  52.05 
 
 		 74 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2876  protein of unknown function DUF433  52.05 
 
 		 74 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0127406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1708  protein of unknown function DUF433  53.62 
 
 		 74 aa  83.6  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4961  hypothetical protein  52.7 
 
 		 76 aa  82.8  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3038  hypothetical protein  52.17 
 
 		 74 aa  82  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.58349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2185  hypothetical protein  52.17 
 
 		 74 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2195  hypothetical protein  52.17 
 
 		 74 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2222  hypothetical protein  50.72 
 
 		 93 aa  80.5  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00122124  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0057  protein of unknown function DUF433  50.72 
 
 		 74 aa  77  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1911  protein of unknown function DUF433  69.39 
 
 		 80 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3160  protein of unknown function DUF433  50.72 
 
 		 82 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.419433  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1367  hypothetical protein  58.62 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.883887  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0601  hypothetical protein  48 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259167  normal  0.179543 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0169  hypothetical protein  50.72 
 
 		 73 aa  70.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2643  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2182  protein of unknown function DUF433  51.47 
 
 		 80 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0840414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5088  protein of unknown function DUF433  55 
 
 		 75 aa  67  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000523487  normal  0.135108 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2493  hypothetical protein  55 
 
 		 76 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.249953 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2639  protein of unknown function DUF433  54.84 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0907931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0429  protein of unknown function DUF433  54.24 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2207  protein of unknown function DUF433  46.88 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000283709 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0538  hypothetical protein  45.59 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0439  hypothetical protein  50.85 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0533  hypothetical protein  55.17 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3854  protein of unknown function DUF433  53.45 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.949031 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1773  protein of unknown function DUF433  50.85 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537848  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4513  protein of unknown function DUF433  51.61 
 
 		 78 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0896  hypothetical protein  45.59 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000110923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4279  protein of unknown function DUF433  48.28 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2485  hypothetical protein  50.85 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1312  hypothetical protein  52.83 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1160  hypothetical protein  43.66 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295531  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5910  protein of unknown function DUF433  45.61 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3561  protein of unknown function DUF433  44.44 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0506112 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1238  hypothetical protein  52.54 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0524363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2054  protein of unknown function DUF433  45.07 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.895596  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2505  hypothetical protein  49.15 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1772  hypothetical protein  47.46 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.5052  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1299  protein of unknown function DUF433  47.69 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1327  protein of unknown function DUF433  47.69 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.225819  normal  0.0285515 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2261  hypothetical protein  44.44 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000450258 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2760  hypothetical protein  47.37 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.986654  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4899  hypothetical protein  49.15 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0636447  normal  0.113291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2776  hypothetical protein  47.46 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0712  hypothetical protein  44.12 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10879  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4619  protein of unknown function DUF433  34.67 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4630  protein of unknown function DUF433  46.88 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.569731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1355  protein of unknown function DUF433  49.12 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0014306  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2516  protein of unknown function DUF433  46.55 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0559942  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4167  hypothetical protein  46.55 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338613  decreased coverage  0.00000145302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2719  hypothetical protein  46.55 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.35645 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2761  hypothetical protein  45.9 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.315321  normal  0.254 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1682  hypothetical protein  43.08 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00134112  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1887  protein of unknown function DUF433  38.24 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2492  hypothetical protein  44.07 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000948417  normal  0.130389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4375  hypothetical protein  43.64 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0117722  normal  0.386132 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4387  protein of unknown function DUF433  58.14 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0716835 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3472  hypothetical protein  41.27 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.84444 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2499  hypothetical protein  41.54 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322714  normal  0.339788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3187  protein of unknown function DUF433  52.63 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.180832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3629  hypothetical protein  45.61 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0695  hypothetical protein  40.79 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.173069  normal  0.725179 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2068  hypothetical protein  50.91 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.254779  normal  0.0154209 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0264  protein of unknown function DUF433  49.15 
 
 		 79 aa  52  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.281649  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5531  protein of unknown function DUF433  41.54 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1636  hypothetical protein  40.68 
 
 		 80 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0516915  decreased coverage  0.000426709 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4945  protein of unknown function DUF433  46 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0459524  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1377  hypothetical protein  38.24 
 
 		 82 aa  50.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2544  protein of unknown function DUF433  40.85 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4592  hypothetical protein  41.18 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.932362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0673  hypothetical protein  39.58 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0278859 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0280  protein of unknown function DUF433  44.44 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.850652  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1154  protein of unknown function DUF433  31.15 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0386  hypothetical protein  46.94 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4930  protein of unknown function DUF433  41.54 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.269597  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0165  protein of unknown function DUF433  31.82 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.313668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0170  protein of unknown function DUF433  33.9 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3849  protein of unknown function DUF433  47.92 
 
 		 201 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0293  protein of unknown function DUF433  47.17 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0523  protein of unknown function DUF433  40 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0117075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2498  hypothetical protein  35 
 
 		 72 aa  43.5  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.799873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6321  hypothetical protein  44.9 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2019  hypothetical protein  43.14 
 
 		 216 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0813587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1362  protein of unknown function DUF433  36.67 
 
 		 199 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0674  hypothetical protein  34.48 
 
 		 105 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.490782  normal  0.33948 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3904  protein of unknown function DUF433  34.78 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1256  hypothetical protein  37.29 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00710383  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3010  hypothetical protein  47.06 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>